29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2777 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2777  cobalt transporter, subunit CbtA  100 
 
 		 236 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0561965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2354  cobalt transporter, subunit CbtA  86.86 
 
 		 228 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2532  cobalt transporter, subunit CbtA  85.59 
 
 		 228 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3101  cobalt transporter subunit CbtA, putative  71.91 
 
 		 233 aa  322  3e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3152  hypothetical protein  72.65 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00956789  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3018  hypothetical protein  69.66 
 
 		 240 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.960935  normal  0.157987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2215  hypothetical protein  69.07 
 
 		 233 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  71.56 
 
 		 364 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6984  cobalt transporter, subunit CbtA  42.74 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4714  cobalt transporter, subunit CbtA  43.22 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2301  hypothetical protein  51.69 
 
 		 181 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.395641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3775  cobalt transporter, subunit CbtA  47.58 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.461264  normal  0.391945 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2525  cobalt transporter, subunit CbtA  37.92 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1440  cobalt transporter, subunit CbtA  42.21 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.473555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1443  cobalt transporter, subunit CbtA  41.27 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.376445 
 
 
-
 
NC_004310  BR1309  hypothetical protein  41.15 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.236923  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1272  hypothetical protein  40.67 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1718  cobalt transporter, subunit CbtA  40.08 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19102  normal  0.0137404 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1874  cobalt transporter, subunit CbtA  40.67 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3112  cobalt transporter, subunit CbtA  40.93 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0398133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2222  cobalt transporter subunit CbtA, putative  34.27 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.338771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2434  cobalt transporter, subunit CbtA  37.99 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.189525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0161  possible cobalt transporter, subunit CbtA  35.81 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.528614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2146  cobalt transporter, subunit CbtA  39.06 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2768  hypothetical protein  33.19 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.319102  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2154  hypothetical protein  32.03 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0542665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1015  hypothetical protein  30.24 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.819928  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0481  hypothetical protein  31.66 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.844634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0446  hypothetical protein  31.66 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0964398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>