More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5106 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5106  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  278  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0410  rhodanese domain-containing protein  91.97 
 
 		 137 aa  248  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.692094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  92.7 
 
 		 137 aa  243  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5055  rhodanese domain-containing protein  93.43 
 
 		 137 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0334  rhodanese-like protein  74.45 
 
 		 137 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206424  normal  0.623131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4245  rhodanese domain-containing protein  63.5 
 
 		 137 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0856379 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4884  rhodanese-like protein  62.04 
 
 		 137 aa  191  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5326  rhodanese-like domain protein  60.58 
 
 		 137 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04680  Rhodanese-like protein  62.04 
 
 		 137 aa  166  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.940144  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5864  hypothetical protein  65.69 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352414  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67750  rhodanese-like domain-containing protein  65.69 
 
 		 139 aa  166  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121316  normal  0.782302 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0495  hypothetical protein  47.69 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  46.38 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3165  rhodanese domain-containing protein  42.96 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  44.93 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  42.45 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  42.45 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  38.13 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  36.69 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  37.41 
 
 		 143 aa  90.1  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  36.69 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 		 144 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  37.41 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  37.41 
 
 		 143 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  36.3 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  36.3 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  37.32 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.24 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  33.82 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  36.57 
 
 		 141 aa  87.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  35.25 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  38.97 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0157  hypothetical protein  31.62 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  35.97 
 
 		 143 aa  84.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  33.1 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  37.04 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  35.77 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  38.13 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2570  rhodanese domain-containing protein  31.43 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  36.76 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  30.5 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  32.59 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  36.03 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1736  rhodanese-like protein  32.82 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.138343  normal  0.316919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0178  Rhodanese domain protein  33.09 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  32.58 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  35.21 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  35.77 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  32.84 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  36.5 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  34.51 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0809  rhodanese domain-containing protein  32.8 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.321585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  34.29 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  34.29 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  33.33 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11691  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 218 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.393301 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  35.59 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  33.61 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  31.34 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.33 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  35.38 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  30.15 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  34.56 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  33.9 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  33.58 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.24 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  30.65 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  41.94 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.85 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>