More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4085 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  27 
 
 		 7214 aa  715    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.6 
 
 		 6919 aa  642    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  51.22 
 
 		 3470 aa  900    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  52.64 
 
 		 2628 aa  2472    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  39.16 
 
 		 2174 aa  857    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  43.08 
 
 		 4317 aa  1818    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  44.5 
 
 		 3294 aa  1786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.17 
 
 		 5953 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.65 
 
 		 6889 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  44.32 
 
 		 4336 aa  1970    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2147  pyoverdine sidechain peptide synthetase I, epsilon-Lys module  42.76 
 
 		 1104 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.240441  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  55.06 
 
 		 2625 aa  2717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  51.11 
 
 		 2151 aa  963    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  63.15 
 
 		 2875 aa  3216    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  41.57 
 
 		 1129 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.85 
 
 		 5929 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.98 
 
 		 1753 aa  713    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.42 
 
 		 3432 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  42.63 
 
 		 4531 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  43.41 
 
 		 5467 aa  1866    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  29.01 
 
 		 2543 aa  1161    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  30.01 
 
 		 3044 aa  1231    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.9 
 
 		 2295 aa  980    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  45.87 
 
 		 3231 aa  1899    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  40.77 
 
 		 3348 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  39.33 
 
 		 1483 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.58 
 
 		 3021 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  44.37 
 
 		 4336 aa  1972    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1957  amino acid adenylation  42.08 
 
 		 1136 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  58.47 
 
 		 2666 aa  1962    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  51.9 
 
 		 2154 aa  957    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  63.73 
 
 		 2883 aa  3210    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  34.68 
 
 		 2979 aa  1136    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.84 
 
 		 5926 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.47 
 
 		 9498 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  44.43 
 
 		 3290 aa  1784    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  28.95 
 
 		 1992 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.7 
 
 		 13537 aa  700    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.31 
 
 		 6676 aa  712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  47.53 
 
 		 5230 aa  2004    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.21 
 
 		 3629 aa  1009    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.24 
 
 		 2867 aa  698    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  38.63 
 
 		 2791 aa  665    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.3 
 
 		 1142 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  43.63 
 
 		 3308 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  39.3 
 
 		 3498 aa  1336    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.87 
 
 		 6006 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.29 
 
 		 2033 aa  1314    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  44.5 
 
 		 3297 aa  1786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  44.39 
 
 		 3287 aa  1796    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  39.33 
 
 		 1483 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  34.42 
 
 		 2979 aa  1131    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  36.23 
 
 		 3962 aa  1253    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  45.2 
 
 		 3235 aa  1890    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  40.86 
 
 		 3291 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  49.71 
 
 		 5654 aa  2226    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  49.22 
 
 		 4502 aa  2274    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  41.44 
 
 		 1383 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  31.14 
 
 		 2410 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  44.56 
 
 		 5422 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  43.56 
 
 		 4882 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  51.9 
 
 		 3432 aa  2457    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  38.85 
 
 		 1520 aa  646    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  43.34 
 
 		 4332 aa  1944    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  44.2 
 
 		 3219 aa  1775    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 		 1833 aa  697    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  46.64 
 
 		 4037 aa  2160    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  40.02 
 
 		 1138 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  32.92 
 
 		 3395 aa  1361    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  34.72 
 
 		 2967 aa  1169    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  30.86 
 
 		 3650 aa  876    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  43.84 
 
 		 3296 aa  1804    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  36.98 
 
 		 4290 aa  748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  44.36 
 
 		 3290 aa  1785    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  36.89 
 
 		 2605 aa  697    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  35.84 
 
 		 4606 aa  1108    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.15 
 
 		 2370 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.72 
 
 		 8914 aa  669    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  42.96 
 
 		 3180 aa  1858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0526  non-ribosomal peptide synthetase  35.64 
 
 		 1675 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  40.48 
 
 		 1405 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  44.47 
 
 		 3231 aa  1782    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  42.71 
 
 		 4383 aa  738    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  43.97 
 
 		 3227 aa  1758    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 		 3176 aa  1070    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  35.97 
 
 		 3018 aa  1278    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  34.41 
 
 		 2979 aa  1117    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  41.1 
 
 		 4478 aa  663    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  43.69 
 
 		 4342 aa  1899    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  49.77 
 
 		 5149 aa  2273    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  38.31 
 
 		 2189 aa  790    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  39.04 
 
 		 2448 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  44.47 
 
 		 3231 aa  1782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  43.16 
 
 		 4317 aa  1819    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  43.6 
 
 		 8646 aa  737    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  38.75 
 
 		 3291 aa  724    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  42.55 
 
 		 2651 aa  1720    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  42.52 
 
 		 1130 aa  717    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  44.5 
 
 		 3294 aa  1786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  38.85 
 
 		 1528 aa  647    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>