More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0093 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  96.04 
 
 		 505 aa  1013    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  78.64 
 
 		 501 aa  841    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  77.45 
 
 		 501 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  80.08 
 
 		 510 aa  857    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  100 
 
 		 505 aa  1045    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  94.65 
 
 		 505 aa  1000    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  79.84 
 
 		 503 aa  822    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  80.64 
 
 		 503 aa  837    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  83.03 
 
 		 502 aa  870    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  96.24 
 
 		 505 aa  1013    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  59.8 
 
 		 513 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  56.8 
 
 		 518 aa  619  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  58.38 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  58.38 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  58.38 
 
 		 517 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  58.46 
 
 		 515 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  58.46 
 
 		 512 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  58.38 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  58.38 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  58.38 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  58.22 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  58.38 
 
 		 522 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  59.06 
 
 		 516 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  59.05 
 
 		 511 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  58.86 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  58.86 
 
 		 516 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  58.66 
 
 		 516 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  58.85 
 
 		 511 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  67.3 
 
 		 594 aa  590  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  59.05 
 
 		 511 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  54.37 
 
 		 509 aa  549  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  49.11 
 
 		 504 aa  482  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  48.31 
 
 		 502 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  49.11 
 
 		 504 aa  475  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  48.41 
 
 		 502 aa  471  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  48.61 
 
 		 498 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  48.51 
 
 		 502 aa  468  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  49.19 
 
 		 496 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  49 
 
 		 501 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  48.01 
 
 		 501 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  48.32 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  47.81 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  49.58 
 
 		 503 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  45.24 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  34.63 
 
 		 489 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  32.82 
 
 		 535 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.72 
 
 		 496 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  29.67 
 
 		 499 aa  167  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3206  sulfatase  29.69 
 
 		 586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.338438  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  27.75 
 
 		 482 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  27.65 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  28.69 
 
 		 537 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  29.33 
 
 		 572 aa  156  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  28.84 
 
 		 549 aa  156  9e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  28.83 
 
 		 474 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  27.83 
 
 		 476 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  30.45 
 
 		 497 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.11 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  29.6 
 
 		 535 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  29.17 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  27.95 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.75 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28950  arylsulfatase A family protein  27.74 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  26.82 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  27.47 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  27.31 
 
 		 508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  29.55 
 
 		 478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  25.79 
 
 		 491 aa  140  6e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  27.55 
 
 		 523 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3468  sulfatase  29.45 
 
 		 466 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  26.91 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  26.91 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.15 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.15 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  26.91 
 
 		 497 aa  137  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  28.06 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  26.72 
 
 		 514 aa  134  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  28.21 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  26.91 
 
 		 497 aa  134  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  27.97 
 
 		 494 aa  133  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.64 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  23.53 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  28.4 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  24.84 
 
 		 481 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  25.49 
 
 		 459 aa  130  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  27.43 
 
 		 447 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  26.71 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.72 
 
 		 499 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  25.57 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.16 
 
 		 498 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  28.67 
 
 		 482 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.71 
 
 		 501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  24.95 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.72 
 
 		 565 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  29 
 
 		 489 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2375  sulfatase family protein  28.43 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0813491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  23.2 
 
 		 480 aa  125  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  26.32 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0996  sulfatase  24.95 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.884308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0945  sulfatase  24.95 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>