More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2518 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1326  ATP-dependent DNA helicase RecG  68.07 
 
 		 714 aa  973    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1869  ATP-dependent DNA helicase RecG  66.07 
 
 		 829 aa  1036    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0363135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1609  ATP-dependent DNA helicase RecG  59.55 
 
 		 717 aa  848    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000503341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1777  ATP-dependent DNA helicase RecG  65.38 
 
 		 767 aa  1025    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00030706  normal  0.0437642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.18 
 
 		 772 aa  956    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1954  ATP-dependent DNA helicase RecG  67.35 
 
 		 765 aa  1051    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1903  ATP-dependent DNA helicase RecG  61.44 
 
 		 772 aa  961    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.15263  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2518  ATP-dependent DNA helicase RecG  100 
 
 		 778 aa  1568    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2210  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.78 
 
 		 904 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1727  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.78 
 
 		 772 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2120  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.64 
 
 		 904 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.460593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4522  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.94 
 
 		 753 aa  571  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.98 
 
 		 818 aa  565  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.81 
 
 		 740 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  44.24 
 
 		 818 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.05 
 
 		 786 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10120  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.06 
 
 		 683 aa  562  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.232228  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1860  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.76 
 
 		 712 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2074  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.3 
 
 		 908 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14532 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.37 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.97 
 
 		 689 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.33 
 
 		 700 aa  548  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 685 aa  544  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.06 
 
 		 817 aa  545  1e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1278  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.1 
 
 		 694 aa  544  1e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1525  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 819 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.11 
 
 		 819 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3245  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.82 
 
 		 697 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.31 
 
 		 685 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0353  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.98 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1158  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.38 
 
 		 827 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.350185  hitchhiker  0.00819024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3183  ATP-dependent DNA helicase RecG  47.04 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.61 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0350  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.96 
 
 		 703 aa  533  1e-150  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.044491  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.37 
 
 		 779 aa  535  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.42 
 
 		 691 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0052  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.08 
 
 		 686 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4390  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.31 
 
 		 693 aa  535  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 		 692 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0822  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.77 
 
 		 684 aa  530  1e-149  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0386  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.87 
 
 		 706 aa  529  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000898372  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1019  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.76 
 
 		 776 aa  530  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000635751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.31 
 
 		 690 aa  532  1e-149  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0601  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.08 
 
 		 842 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  43 
 
 		 693 aa  530  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2401  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.64 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4024  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 693 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 693 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0647882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4131  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 693 aa  528  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.193478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2910  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.51 
 
 		 693 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.39 
 
 		 691 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4070  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.25 
 
 		 693 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.75743 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00625  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.43 
 
 		 693 aa  528  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001866  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 		 689 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03509  ATP-dependent DNA helicase  45.26 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0053  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0351  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.3 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0059  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5025  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3961  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.11 
 
 		 693 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1164  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.86 
 
 		 692 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03461  hypothetical protein  45.26 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3641  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.04 
 
 		 862 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.091559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0288  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.64 
 
 		 832 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.116338  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3863  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0450  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.36 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4156  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.26 
 
 		 693 aa  524  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.07 
 
 		 818 aa  524  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.94 
 
 		 719 aa  525  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3518  ATP-dependent DNA helicase RecG  39.53 
 
 		 842 aa  524  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.82204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.03 
 
 		 702 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4103  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.11 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3507  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 691 aa  525  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3987  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.4 
 
 		 693 aa  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0346  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 696 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5219  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.38 
 
 		 692 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.220014  normal  0.443316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.42 
 
 		 692 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0923  ATP-dependent DNA helicase RecG  46.02 
 
 		 680 aa  522  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.452189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0344  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.22 
 
 		 696 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0354  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.15 
 
 		 691 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000206115 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5310  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.09 
 
 		 692 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0627539 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4213  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.17 
 
 		 693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1216  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.1 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.999568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.74 
 
 		 815 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2072  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.74 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000101062  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1776  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.79 
 
 		 704 aa  514  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00133724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  47 
 
 		 728 aa  514  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5559  ATP-dependent DNA helicase RecG  45.13 
 
 		 691 aa  515  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.89 
 
 		 822 aa  514  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3884  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.29 
 
 		 696 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0411  ATP-dependent DNA helicase RecG  40.65 
 
 		 704 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000341612  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4364  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.24 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48450  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.68 
 
 		 691 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0201  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.19 
 
 		 691 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.26 
 
 		 679 aa  511  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0328  ATP-dependent DNA helicase RecG  41.72 
 
 		 706 aa  510  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.171796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3952  ATP-dependent DNA helicase RecG  44.54 
 
 		 693 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3672  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.1 
 
 		 696 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0149204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4496  ATP-dependent DNA helicase RecG  43.6 
 
 		 693 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  42.24 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0310483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>