36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0901 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  36.42 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 184 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  39.19 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  37.42 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  33.96 
 
 		 180 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  37.67 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  35.92 
 
 		 146 aa  93.2  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  88.6  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  35.19 
 
 		 199 aa  88.2  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30.72 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 177 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  30.56 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  32.14 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  28.16 
 
 		 217 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  28.86 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  28.98 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  35.76 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  27.33 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  26.9 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  34.84 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  28.85 
 
 		 185 aa  52.4  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  28.29 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  22.86 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  27.63 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  27.63 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  28.97 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05846  hypothetical protein  24.5 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  28.03 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  26.44 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  28.03 
 
 		 265 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  28.87 
 
 		 236 aa  41.6  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  22.89 
 
 		 167 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  25.19 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>