264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0053 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  82.6 
 
 
431 aa  754    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 
431 aa  892    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  74.25 
 
 
431 aa  664    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  73.89 
 
 
432 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.18 
 
 
437 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.1 
 
 
437 aa  462  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52 
 
 
437 aa  462  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.03 
 
 
441 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.12 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.58 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.65 
 
 
428 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44 
 
 
441 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  43.37 
 
 
431 aa  375  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.92 
 
 
453 aa  351  2e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.42 
 
 
431 aa  347  3e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  41.12 
 
 
431 aa  345  8.999999999999999e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.86 
 
 
455 aa  345  1e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.43 
 
 
432 aa  342  8e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.08 
 
 
431 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.46 
 
 
645 aa  339  4e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  40 
 
 
431 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.46 
 
 
434 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  40.34 
 
 
615 aa  325  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.77 
 
 
443 aa  322  7e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.49 
 
 
445 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.26 
 
 
445 aa  317  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.98 
 
 
430 aa  316  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.31 
 
 
611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.4 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.1 
 
 
617 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.53 
 
 
627 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.47 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.44 
 
 
428 aa  309  8e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.44 
 
 
449 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.1 
 
 
449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.92 
 
 
428 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.7 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.92 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.92 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.68 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.23 
 
 
428 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.95 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.76 
 
 
430 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.78 
 
 
432 aa  301  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.27 
 
 
433 aa  301  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.09 
 
 
616 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.09 
 
 
616 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  38.18 
 
 
622 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.47 
 
 
428 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39 
 
 
424 aa  300  3e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.1 
 
 
424 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.7 
 
 
428 aa  299  7e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.86 
 
 
424 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.86 
 
 
424 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.91 
 
 
634 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.63 
 
 
437 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.63 
 
 
428 aa  296  4e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.67 
 
 
440 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.67 
 
 
440 aa  294  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.44 
 
 
440 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.41 
 
 
444 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.42 
 
 
428 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.01 
 
 
623 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.35 
 
 
429 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.59 
 
 
636 aa  289  6e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.9 
 
 
428 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  37.41 
 
 
438 aa  287  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.38 
 
 
614 aa  286  5e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.5 
 
 
446 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.45 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.43 
 
 
479 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.65 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.99 
 
 
447 aa  282  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.59 
 
 
441 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.59 
 
 
441 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.59 
 
 
441 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.1 
 
 
447 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  36.3 
 
 
432 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  38.1 
 
 
447 aa  280  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.01 
 
 
446 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.59 
 
 
441 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.98 
 
 
430 aa  280  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0577  4-hydroxybutyrate CoA transferase (cat2-1)  38 
 
 
444 aa  279  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537722  hitchhiker  0.000215809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.9 
 
 
445 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  37.22 
 
 
445 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.21 
 
 
446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.88 
 
 
634 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  36.7 
 
 
449 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.09 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.09 
 
 
445 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.09 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  41.09 
 
 
443 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.44 
 
 
407 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.11 
 
 
420 aa  272  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.71 
 
 
432 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.8 
 
 
443 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  40.52 
 
 
443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.52 
 
 
443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.28 
 
 
446 aa  269  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.3 
 
 
448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>