More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2101 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  100 
 
 		 614 aa  1231    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  46.46 
 
 		 624 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  44.55 
 
 		 641 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  41.74 
 
 		 642 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  30.3 
 
 		 622 aa  260  6e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  32.76 
 
 		 613 aa  251  4e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  30.64 
 
 		 617 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  30.64 
 
 		 617 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  35.6 
 
 		 625 aa  240  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  31.18 
 
 		 609 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  28.71 
 
 		 607 aa  231  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  31.13 
 
 		 611 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  28.55 
 
 		 638 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  27.35 
 
 		 607 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  28.38 
 
 		 647 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  26.98 
 
 		 600 aa  227  6e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  31.58 
 
 		 638 aa  224  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  31.4 
 
 		 635 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  32.36 
 
 		 637 aa  206  9e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  32.63 
 
 		 637 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  30.34 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  29.79 
 
 		 600 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  27.84 
 
 		 602 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  26.89 
 
 		 595 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  28.03 
 
 		 602 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  30.06 
 
 		 621 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  30.06 
 
 		 621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  29.76 
 
 		 621 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  26.12 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  27.95 
 
 		 630 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  28.78 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  27.67 
 
 		 593 aa  153  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  27.85 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  27.85 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  27.85 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  27.98 
 
 		 590 aa  144  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  28.52 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  28.85 
 
 		 586 aa  143  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  28.52 
 
 		 586 aa  142  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  27.05 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  27.05 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  27.05 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  27.05 
 
 		 586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  27.14 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  27.54 
 
 		 590 aa  132  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  24.83 
 
 		 604 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  25.75 
 
 		 582 aa  130  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.9 
 
 		 596 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  26.71 
 
 		 596 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  26 
 
 		 596 aa  127  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  27.11 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  26.8 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  25.68 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  26.24 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  25.52 
 
 		 594 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  27.99 
 
 		 592 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  26.04 
 
 		 595 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  27.56 
 
 		 595 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  27.3 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  27.3 
 
 		 595 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  23.34 
 
 		 580 aa  111  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  25.45 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  27.45 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  23.53 
 
 		 594 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  26.71 
 
 		 784 aa  104  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  27.53 
 
 		 630 aa  97.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  28.27 
 
 		 873 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  31.61 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0854  sulfatase  25.31 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  30.73 
 
 		 515 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  40.57 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  34.23 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  33.56 
 
 		 511 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  26.79 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  26.79 
 
 		 516 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  27.24 
 
 		 516 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  32.47 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  31.98 
 
 		 1065 aa  78.2  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.36 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  30.48 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  42.39 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  35.2 
 
 		 478 aa  75.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2740  sulfatase  24.56 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000010539  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0306  arylsulfatase  37.1 
 
 		 1041 aa  74.7  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  25.72 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  26.59 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  25.07 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  41.3 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  41.3 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  24.49 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  41.3 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  41.3 
 
 		 517 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  41.3 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  41.3 
 
 		 522 aa  72  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>