70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3113 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 137 aa  271  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.35 
 
 		 143 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  35.71 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  40.35 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  39.52 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  42.48 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  36.97 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  38.89 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  35.29 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  35.4 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.61 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.93 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.93 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  41.32 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  39.83 
 
 		 129 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  34.19 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.82 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  35.09 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  35.71 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  36.28 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  34.82 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  40.38 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.74 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  34.38 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  39.42 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  38.79 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.31 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.14 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.39 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  34.82 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  35.35 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.48 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  35.4 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  38.46 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.79 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  33.04 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.82 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.93 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 		 147 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  34.75 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  33.04 
 
 		 143 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.69 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.36 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.35 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  33.91 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  28.57 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  31.86 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.14 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  31.09 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  32 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  32 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  32.67 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.68 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  28.28 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  26.56 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  29.2 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.51 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>