70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3113 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 
137 aa  271  2e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.35 
 
 
143 aa  87.8  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  35.71 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  40.35 
 
 
143 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  39.52 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  83.2  1e-15  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  42.48 
 
 
143 aa  81.3  4e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  36.97 
 
 
145 aa  81.3  5e-15  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  38.89 
 
 
129 aa  80.5  6e-15  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  35.4 
 
 
143 aa  79.3  1e-14  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  35.29 
 
 
145 aa  80.1  1e-14  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  36.61 
 
 
143 aa  79  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.93 
 
 
144 aa  79  2e-14  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  41.32 
 
 
129 aa  79  2e-14  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  37.5 
 
 
143 aa  79.3  2e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14069e-13 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.93 
 
 
143 aa  79  2e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  39.83 
 
 
129 aa  78.6  3e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  34.19 
 
 
143 aa  78.6  3e-14  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 
143 aa  77.8  4e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  37.82 
 
 
143 aa  77.4  5e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  35.09 
 
 
143 aa  77.4  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  35.71 
 
 
143 aa  76.6  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  36.28 
 
 
144 aa  76.3  1e-13  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  34.82 
 
 
143 aa  75.9  2e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  40.38 
 
 
129 aa  75.9  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  36.61 
 
 
143 aa  76.3  2e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  35.71 
 
 
143 aa  75.9  2e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.74 
 
 
143 aa  75.1  3e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  34.38 
 
 
142 aa  73.9  6e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  33.33 
 
 
143 aa  73.9  7e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  39.42 
 
 
129 aa  73.9  8e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  38.79 
 
 
144 aa  73.2  1e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.14 
 
 
147 aa  72.8  2e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.31 
 
 
145 aa  72.4  2e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  38.39 
 
 
142 aa  72.8  2e-12  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  35.35 
 
 
151 aa  71.6  3e-12  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.48 
 
 
141 aa  72  3e-12  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  34.82 
 
 
143 aa  72  3e-12  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  38.46 
 
 
129 aa  71.2  4e-12  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  35.4 
 
 
143 aa  71.2  4e-12  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.79 
 
 
143 aa  70.9  6e-12  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  33.04 
 
 
143 aa  70.1  1e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.82 
 
 
147 aa  69.3  2e-11  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.19299e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  33.93 
 
 
170 aa  68.9  2e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 
147 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  34.75 
 
 
147 aa  68.6  3e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  31.97 
 
 
149 aa  67  9e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.35 
 
 
143 aa  66.6  1e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  33.04 
 
 
143 aa  66.2  1e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  30.36 
 
 
143 aa  66.6  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 
141 aa  66.2  1e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 
141 aa  66.2  1e-10  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.9 
 
 
141 aa  66.6  1e-10  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.69 
 
 
153 aa  66.2  1e-10  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  34.75 
 
 
147 aa  66.6  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.71 
 
 
129 aa  64.3  5e-10  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  33.91 
 
 
144 aa  63.5  8e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  28.57 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  31.86 
 
 
142 aa  63.2  1e-09  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  32.14 
 
 
135 aa  61.2  5e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  31.09 
 
 
144 aa  59.7  1e-08  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  32 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  33 
 
 
151 aa  57.8  5e-08  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  57.4  7e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  32.67 
 
 
142 aa  56.2  1e-07  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  31.68 
 
 
142 aa  56.2  2e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  28.28 
 
 
144 aa  53.9  6e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  26.56 
 
 
136 aa  52.4  2e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  29.2 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.51 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>