48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1859 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  100 
 
 		 519 aa  1066    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  43.11 
 
 		 458 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  42.31 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  40.41 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  43.28 
 
 		 478 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  41.28 
 
 		 480 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  40.68 
 
 		 453 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  42.33 
 
 		 432 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  41.91 
 
 		 432 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  41.21 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  39.22 
 
 		 468 aa  324  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  37.39 
 
 		 536 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  39.15 
 
 		 441 aa  322  9.999999999999999e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  38.53 
 
 		 578 aa  306  7e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  37.2 
 
 		 538 aa  301  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  36.58 
 
 		 538 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  36.32 
 
 		 538 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  36.45 
 
 		 435 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  37.25 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  37.25 
 
 		 436 aa  286  5e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  37.83 
 
 		 436 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  36.59 
 
 		 435 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  36.56 
 
 		 472 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  35.1 
 
 		 434 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  35.15 
 
 		 499 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  37.31 
 
 		 466 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  36.04 
 
 		 466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  36.3 
 
 		 452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  35.49 
 
 		 427 aa  274  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  37.04 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  36.32 
 
 		 466 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  36.32 
 
 		 466 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  36.53 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  35.55 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  36.11 
 
 		 466 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  35.55 
 
 		 460 aa  270  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  35.55 
 
 		 460 aa  270  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  35.09 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  35.22 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  36.76 
 
 		 438 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  35.67 
 
 		 470 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  31.14 
 
 		 437 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  34.21 
 
 		 844 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2884  cell division cycle protein  26.67 
 
 		 764 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884103  normal  0.239009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  26.67 
 
 		 775 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1492  26S proteasome subunit P45 family  32.26 
 
 		 405 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  29.94 
 
 		 379 aa  43.5  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2440  26S proteasome subunit P45 family  32.26 
 
 		 405 aa  43.5  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.683405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>