173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1190 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
456 aa  919    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  32.52 
 
 
446 aa  208  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  42.53 
 
 
277 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  41.63 
 
 
294 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  41.63 
 
 
294 aa  156  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  40.62 
 
 
294 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  44.68 
 
 
559 aa  140  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  43.42 
 
 
293 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  47.14 
 
 
310 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  41.22 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  46.43 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  32.8 
 
 
310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  39.46 
 
 
288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  43.42 
 
 
649 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  45.71 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  44.68 
 
 
443 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  42.36 
 
 
540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  42.04 
 
 
270 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  42.77 
 
 
197 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  43.24 
 
 
265 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  32.7 
 
 
270 aa  123  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  33.33 
 
 
270 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  36.36 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  34.11 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  33.01 
 
 
268 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  42.55 
 
 
195 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  40.82 
 
 
268 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  35.76 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1936  phosphotransferase system enzyme IIA, regulates nitrogen metabolism  32.61 
 
 
153 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4961  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.25 
 
 
156 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3816  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.95 
 
 
618 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000120874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1486  PTS system, fructose-specific IIABC component  29.37 
 
 
618 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00732656  hitchhiker  0.00389815 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3563  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.16 
 
 
622 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0301222  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3462  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  30.16 
 
 
619 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000328489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3846  PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC  30.16 
 
 
626 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000062066  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2631  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.68 
 
 
148 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0425  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.87 
 
 
149 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0194997 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3023  phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system, EIIA component  31.68 
 
 
148 aa  58.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3726  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.16 
 
 
618 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2187600000000001e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3476  PTS fructose-specific enzyme IIBC component  30.16 
 
 
619 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000542106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3482  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.37 
 
 
619 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0610802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3767  PTS system, fructose-specific IIABC component  30.16 
 
 
619 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000180582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3744  PTS system, fructose-specific IIABC component  29.37 
 
 
618 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000405115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1503  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.36 
 
 
149 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.19999  hitchhiker  0.00280102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0550  fructose specific permease  29.6 
 
 
630 aa  53.9  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  40.91 
 
 
275 aa  53.9  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1968  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.61 
 
 
153 aa  53.9  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00203229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2394  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  29.03 
 
 
618 aa  53.5  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.123557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0014  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.03 
 
 
154 aa  53.5  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000106322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0564  PTS system, fructose-specific, IIABC component  29.6 
 
 
630 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3615  multiphosphoryl transfer protein 1  31.82 
 
 
831 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.629067 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02293  fused predicted PTS enzymes: Hpr component/enzyme I component/enzyme IIA component  30.91 
 
 
831 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02254  hypothetical protein  30.91 
 
 
831 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2109  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.08 
 
 
175 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000418392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  42.47 
 
 
266 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2535  multiphosphoryl transfer protein 1  31.82 
 
 
831 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  28.45 
 
 
363 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1286  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30.91 
 
 
831 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.807752  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1618  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.52 
 
 
153 aa  52.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.999957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2673  multiphosphoryl transfer protein 1  31.82 
 
 
831 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  40 
 
 
282 aa  51.2  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2395  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  31.25 
 
 
235 aa  50.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0160  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.55 
 
 
153 aa  50.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0103  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.34 
 
 
154 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  22.86 
 
 
154 aa  50.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0484088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2970  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.89 
 
 
156 aa  50.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.28184  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  42.42 
 
 
285 aa  50.4  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1274  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  30 
 
 
831 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0111  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30 
 
 
153 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2520  multiphosphoryl transfer protein 1  30 
 
 
831 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1512  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  30.89 
 
 
623 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0359  PTS system, fructose-specific IIABC components  29.03 
 
 
650 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3758  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  28.72 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0706  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.68 
 
 
161 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.460363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1726  fusion of IIA, IIB and IIC component of mannitol/fructose-specific phosphotransferase system mannitol/fructose-specific  26.56 
 
 
661 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1573  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.79 
 
 
153 aa  49.7  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.06 
 
 
149 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000039829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  29.17 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  43.94 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0148  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  23.53 
 
 
149 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0179648  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2067  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.1 
 
 
153 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  30.43 
 
 
352 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2649  PTS system, fructose subfamily, IIC subunit  32.81 
 
 
623 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  39.39 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  39.39 
 
 
273 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.61 
 
 
148 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  39.39 
 
 
273 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  41.79 
 
 
277 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  30.7 
 
 
358 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1599  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  24.39 
 
 
149 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02225  nitrogen regulatory IIA protein  28.67 
 
 
152 aa  47.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  36.99 
 
 
351 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>