19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2500 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  767    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000111187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4406  hypothetical protein  52.43 
 
 		 367 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2219  hypothetical protein  50.14 
 
 		 363 aa  345  5e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2245  hypothetical protein  47.44 
 
 		 363 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7978  hypothetical protein  34.76 
 
 		 376 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.369377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4498  hypothetical protein  33.24 
 
 		 371 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3975  hypothetical protein  34.34 
 
 		 361 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1820  hypothetical protein  35.39 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13190  hypothetical protein  32.88 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.269746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1868  hypothetical protein  31.9 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4605  hypothetical protein  33.6 
 
 		 381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3635  hypothetical protein  32.08 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1559  hypothetical protein  31.23 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.970471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1583  hypothetical protein  31.23 
 
 		 379 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1529  hypothetical protein  30.97 
 
 		 379 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178306  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2009  hypothetical protein  26.26 
 
 		 377 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0128163  normal  0.280016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3398  hypothetical protein  25.27 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.362896  normal  0.482648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5453  hypothetical protein  33.56 
 
 		 172 aa  76.3  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0285  hypothetical protein  28.5 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0819327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>