More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0187 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_0187  superoxide dismutase  100 
 
 
204 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.457319 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1895  superoxide dismutase  58.67 
 
 
201 aa  253  1e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.514974  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0967  superoxide dismutase  56.7 
 
 
198 aa  248  3e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.324729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1195  Superoxide dismutase  55.84 
 
 
201 aa  246  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.174298 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1760  superoxide dismutase  58.08 
 
 
227 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1224  superoxide dismutase  56.85 
 
 
200 aa  240  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4520  Superoxide dismutase  54.82 
 
 
199 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.111456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1767  superoxide dismutase  55.61 
 
 
197 aa  237  7e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0983  superoxide dismutase  54.36 
 
 
200 aa  233  2e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.474017  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1098  Superoxide dismutase  52.28 
 
 
200 aa  231  5e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00115059  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0309  superoxide dismutase  55.45 
 
 
209 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.00167e-10  normal  0.123297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0424  Superoxide dismutase  52.55 
 
 
200 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0435  Superoxide dismutase  52.55 
 
 
200 aa  228  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1462  Superoxide dismutase  56.85 
 
 
201 aa  228  4e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0801  superoxide dismutase  55.56 
 
 
229 aa  228  4e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.818705  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2231  superoxide dismutase  54.46 
 
 
209 aa  228  5e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.138475 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2067  superoxide dismutase, Fe  56.48 
 
 
210 aa  228  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.854961  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2803  Superoxide dismutase  56.7 
 
 
233 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.327122  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2397  Superoxide dismutase  56.7 
 
 
233 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3417  manganese and iron superoxide dismutase  51.27 
 
 
241 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0123938 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0378  Superoxide dismutase  54.08 
 
 
198 aa  226  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000638563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1938  superoxide dismutase  53.96 
 
 
209 aa  226  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.268541  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0501  superoxide dismutase  54.69 
 
 
205 aa  225  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2271  superoxide dismutase  55.15 
 
 
221 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00171574  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2458  superoxide dismutase, Fe  57.95 
 
 
194 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.688146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0566  superoxide dismutase  55.15 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0641217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1043  superoxide dismutase  55.15 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00491913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2148  superoxide dismutase  55.15 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0933  superoxide dismutase (Fe)  55.15 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0930  superoxide dismutase (Fe)  55.15 
 
 
192 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0744  superoxide dismutase  54.64 
 
 
221 aa  224  7e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1085  superoxide dismutase  54.64 
 
 
221 aa  224  8e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00846047  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1539  Superoxide dismutase  53.54 
 
 
200 aa  224  1e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0738  superoxide dismutase, Fe  54.5 
 
 
206 aa  223  1e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2481  superoxide dismutase  54.64 
 
 
193 aa  222  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.152277  normal  0.398942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6857  Superoxide dismutase  54.97 
 
 
197 aa  222  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0552512 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0540  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.950904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0597  superoxide dismutase  55.38 
 
 
193 aa  220  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00195013  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0769  superoxide dismutase  54.12 
 
 
192 aa  219  2e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0885  SecE subunit of protein translocation complex  53.57 
 
 
193 aa  219  2e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.05445e-15  hitchhiker  6.30572e-06 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0753  superoxide dismutase  54.12 
 
 
192 aa  218  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174612  normal  0.215519 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5874  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0166877  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2461  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  218  4e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028549 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2591  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  218  4e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02750  iron superoxide dismutase  53.06 
 
 
193 aa  218  7e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2897  superoxide dismutase, iron  55.33 
 
 
192 aa  217  9e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2567  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  217  9e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000701248  normal  0.136578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1931  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  217  9e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2543  superoxide dismutase  54.64 
 
 
192 aa  217  9e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166129  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3039  superoxide dismutase, iron  55.33 
 
 
192 aa  216  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1385  superoxide dismutase  55.15 
 
 
192 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1660  Superoxide dismutase  53.81 
 
 
199 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3194  Superoxide dismutase  52.58 
 
 
192 aa  215  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194093  normal  0.452704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0539  manganese and iron superoxide dismutase  53.33 
 
 
192 aa  214  7e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  2.429e-05  hitchhiker  1.11544e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0981  superoxide dismutase  53.3 
 
 
198 aa  213  1e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581007  hitchhiker  0.000228043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1541  superoxide dismutase  54.08 
 
 
193 aa  213  1e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000210127  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03014  superoxide dismutase  51.52 
 
 
199 aa  213  2e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3621  Superoxide dismutase  53.44 
 
 
199 aa  212  2e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1912  superoxide dismutase  54.08 
 
 
193 aa  213  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137482  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4281  superoxide dismutase  54.17 
 
 
199 aa  213  2e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1743  superoxide dismutase  54.08 
 
 
193 aa  213  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.40254e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1527  superoxide dismutase  54.08 
 
 
193 aa  213  2e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56780  superoxide dismutase  53.06 
 
 
193 aa  213  2e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4937  superoxide dismutase  53.06 
 
 
193 aa  212  3e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4486  superoxide dismutase  52.79 
 
 
198 aa  212  3e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1395  superoxide dismutase  51.02 
 
 
193 aa  212  3e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2066  Superoxide dismutase  51.53 
 
 
236 aa  212  3e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1927  superoxide dismutase  54.12 
 
 
193 aa  212  3e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.630056  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0954  superoxide dismutase  52.79 
 
 
198 aa  212  4e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.80559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2023  superoxide dismutase  53.06 
 
 
192 aa  212  4e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.110295  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0915  superoxide dismutase  52.79 
 
 
198 aa  212  4e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1963  superoxide dismutase  52.04 
 
 
194 aa  211  5e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1601  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  211  5e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3219  Superoxide dismutase  52.06 
 
 
194 aa  211  6e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1632  superoxide dismutase, Fe  52.02 
 
 
194 aa  211  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.40787e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1775  superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.80024e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1782  superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.39358e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2503  Superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  2.89489e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3498  Superoxide dismutase  53.68 
 
 
199 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.220165  normal  0.735889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3476  superoxide dismutase  50 
 
 
194 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37820  Fe-Superoxide dismutase  52.04 
 
 
193 aa  210  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41434  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4473  superoxide dismutase  52.28 
 
 
198 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.125166 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3298  superoxide dismutase  52.91 
 
 
199 aa  210  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.378679  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1819  superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.21956e-07  normal  0.282643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002934  superoxide dismutase (Fe)  50.51 
 
 
194 aa  210  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.74974e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4998  Superoxide dismutase  52.58 
 
 
193 aa  209  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1163  Superoxide dismutase  49.22 
 
 
207 aa  209  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2568  superoxide dismutase  52.58 
 
 
194 aa  209  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28771  decreased coverage  0.00195196 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01626  superoxide dismutase, Fe  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1984  Superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.621128  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1735  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0141664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1639  manganese and iron superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  209  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  9.20942e-09  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2368  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0034219  normal  0.192505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1869  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.39054e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1572  superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  3.80978e-09  normal  0.113962 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1647  superoxide dismutase  51.02 
 
 
194 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.41638e-07  hitchhiker  0.000247019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3322  superoxide dismutase  51.53 
 
 
193 aa  209  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1973  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009948 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1542  superoxide dismutase  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.695463  normal  0.165364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01616  hypothetical protein  53.57 
 
 
193 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>