219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3724 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3724  AzlC family protein  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2616  hypothetical protein  53.42 
 
 
319 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.65321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1188  AzlC family protein  50.44 
 
 
236 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1542  AzlC family protein  46.19 
 
 
224 aa  204  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.587994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3541  AzlC family protein  42.33 
 
 
267 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000459518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3167  AzlC family protein  38.12 
 
 
225 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0320  AzlC family protein  36.28 
 
 
227 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000218958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1793  branched-chain amino acid permease  32.07 
 
 
267 aa  143  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0942  branched-chain amino acid transport protein  32.86 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147188  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2862  AzlC-like  37.61 
 
 
248 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6337  AzlC family protein  41.71 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167146 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2142  AzlC family protein  39.2 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.457297  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1280  branched chain amino acid efflux pump, LivE family, large subunit  35.21 
 
 
243 aa  130  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.228947  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1930  AzlC family protein  35.47 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0102  branched-chain amino acid transport protein  31.31 
 
 
251 aa  124  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000879115  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12370  predicted branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  33.48 
 
 
250 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1105  AzlC-like  31.88 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.316521  normal  0.217152 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1543  AzlC family protein  32.89 
 
 
249 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00537066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7860  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)-like protein  39.13 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2750  putative branched-chain amino acid transporter  34.86 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.870625  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4248  AzlC family protein  37.87 
 
 
237 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  39.77 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1053  branched chain amino acid ABC transporter  30.39 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3787  AzlC family protein  40.24 
 
 
233 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  35 
 
 
240 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03312  putative amino acid transporter  34.12 
 
 
240 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2382  AzlC family protein  34.88 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000630711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3255  AzlC family protein  38.6 
 
 
230 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.892641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  33.69 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  28.5 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  32.45 
 
 
282 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  33.68 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  30.59 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  32.04 
 
 
240 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  31.43 
 
 
237 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  29.07 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0194  AzlC family protein  29.78 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.422713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02537  predicted transporter  29.2 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1002  AzlC family protein  29.2 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02502  hypothetical protein  29.2 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1025  AzlC family protein  29.2 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0836238 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2818  branched chain amino acid ABC transporter  29.2 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2965  branched chain amino acid ABC transporter  29.2 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09380  4-azaleucine resistance probable transporter AzlC  30.73 
 
 
279 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2804  branched chain amino acid ABC transporter  29.95 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.1492  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3926  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  29.95 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.645111 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  28.57 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  28.96 
 
 
257 aa  87  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.67 
 
 
233 aa  87  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  28.96 
 
 
257 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  28.96 
 
 
257 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01830  AzlC family protein  33.69 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.79674  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  30.98 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  29.19 
 
 
243 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0119  AzlC family protein  28.89 
 
 
302 aa  84  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102803  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  29.73 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1477  AzlC family protein  29.61 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  31.61 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  33.71 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0010  hypothetical protein  31.15 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0010  hypothetical protein  31.15 
 
 
231 aa  82.8  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  28.57 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  29.29 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  32.41 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  30.85 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  38.6 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0944  AzlC family protein  31.55 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.77629e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  33.11 
 
 
238 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  30.43 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.03 
 
 
250 aa  79  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  29.49 
 
 
242 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1426  AzlC-like protein  28.8 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000261082  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.24 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  24.89 
 
 
239 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  31.32 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.61 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2543  azlC protein, putative  29.19 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.64 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.64 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.64 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.64 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.18 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2222  AzlC family protein  26.15 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.51 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  31.12 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  27.73 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.91 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0390  AzlC-like protein  32.79 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.709784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  30.6 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  28.91 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  31.46 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  27.27 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0648  AzlC family protein  29.71 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000031666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  27.31 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  28.28 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  29.32 
 
 
286 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  27.63 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  27.63 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  27.63 
 
 
273 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.32 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>