21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0438 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0438  transporter of NadC family protein  100 
 
 		 516 aa  1040    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0809046  normal  0.0220844 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 504 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 504 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 513 aa  67.8  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.39 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.602182  normal  0.0588594 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3744  hypothetical protein  22 
 
 		 525 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.788366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1572  polysaccharide biosynthesis protein  21.92 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0827  polysaccharide biosynthesis protein  20.53 
 
 		 522 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.769454  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0958  polysaccharide biosynthesis protein  20.72 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.393592  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  23.18 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 488 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  20.36 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0954  polysaccharide biosynthesis protein  20.74 
 
 		 514 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.861474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 492 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  19.94 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 		 478 aa  43.9  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  20.16 
 
 		 499 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>