More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2973 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2768  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.6 
 
 		 1295 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.55 
 
 		 1295 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1111  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.55 
 
 		 1295 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.503937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2727  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.6 
 
 		 1295 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1354 aa  655    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1037  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.3 
 
 		 1299 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0296  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  60.21 
 
 		 1234 aa  1534    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.391304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1915  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.94 
 
 		 1360 aa  674    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0662626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0673  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.81 
 
 		 1288 aa  668    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0903216  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1120  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.38 
 
 		 1295 aa  717    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1722  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.48 
 
 		 1369 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.166635 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0395  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.2 
 
 		 1297 aa  724    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3675  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.35 
 
 		 1323 aa  676    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3623  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.5 
 
 		 1296 aa  689    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1034  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.4 
 
 		 1299 aa  655    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.559579  normal  0.890548 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3287  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.89 
 
 		 1293 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.98 
 
 		 1298 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3042  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.88 
 
 		 1295 aa  714    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631936  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1147  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.63 
 
 		 1296 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3414  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.88 
 
 		 1298 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1446  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1353 aa  654    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2994  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.27 
 
 		 1293 aa  697    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1078  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.38 
 
 		 1299 aa  660    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.528102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06195  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  70.92 
 
 		 1214 aa  1833    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.2 
 
 		 1298 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2943  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.68 
 
 		 1295 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1925  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.28 
 
 		 1309 aa  701    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.741982 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41441  predicted protein  35.33 
 
 		 1348 aa  720    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1390  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.77 
 
 		 1348 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256104  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.47 
 
 		 1295 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1353 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0629  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.96 
 
 		 1318 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.385038 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2831  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.6 
 
 		 1295 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2922  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.38 
 
 		 1295 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2463  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1366 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1907  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.22 
 
 		 1300 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.819061  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0999  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.98 
 
 		 1298 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2484  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.38 
 
 		 1301 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234479  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1253  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.71 
 
 		 1296 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5215  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.38 
 
 		 1354 aa  656    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903244  normal  0.536737 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4724  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  76.89 
 
 		 1217 aa  1975    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375625  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0746  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.8 
 
 		 1296 aa  687    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4189  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.3 
 
 		 1299 aa  658    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1550  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.97 
 
 		 1292 aa  706    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00364402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2642  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.6 
 
 		 1293 aa  702    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.873456  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2383  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.34 
 
 		 1303 aa  681    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2196  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.21 
 
 		 1299 aa  689    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0353893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.8 
 
 		 1414 aa  665    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.077761  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1301  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.98 
 
 		 1293 aa  697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1564  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.42 
 
 		 1293 aa  707    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3138  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.25 
 
 		 1293 aa  696    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217265 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.31 
 
 		 1341 aa  643    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226471  unclonable  0.00000000702475 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0643  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.73 
 
 		 1306 aa  686    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  32.83 
 
 		 1409 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.466313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1478  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.89 
 
 		 1290 aa  685    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.704135 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3099  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.83 
 
 		 1347 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0887  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.18 
 
 		 1297 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.723631  normal  0.152972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1031  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.18 
 
 		 1297 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.691953 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1022  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.36 
 
 		 1359 aa  666    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2283  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.05 
 
 		 1361 aa  672    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.47 
 
 		 1293 aa  711    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000193442  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2342  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.38 
 
 		 1359 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1832  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.23 
 
 		 1357 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.875637 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0841  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.42 
 
 		 1313 aa  645    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3368  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1356 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.930904  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2808  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.68 
 
 		 1295 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1870  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.94 
 
 		 1348 aa  679    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.395748 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0002  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.23 
 
 		 1297 aa  675    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6165  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1354 aa  656    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.08 
 
 		 1293 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3113  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.61 
 
 		 1295 aa  671    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2710  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.55 
 
 		 1295 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  63.58 
 
 		 1231 aa  1602    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.209803  normal  0.519263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4851  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.44 
 
 		 1342 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01150  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.86 
 
 		 1298 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1503  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.35 
 
 		 1297 aa  682    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1238  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.76 
 
 		 1293 aa  700    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1309  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.6 
 
 		 1293 aa  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2474  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.49 
 
 		 1295 aa  667    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1141  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.19 
 
 		 1293 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1902  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.16 
 
 		 1354 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0378241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15740  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.36 
 
 		 1298 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.989806  hitchhiker  0.000000174992 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1210  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.41 
 
 		 1356 aa  654    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01396  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.97 
 
 		 1295 aa  689    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75569  5'-phosphoribosylformyl glycinamidine synthetase  37.04 
 
 		 1343 aa  706    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0273535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1360  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.51 
 
 		 1354 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1317  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.49 
 
 		 1293 aa  699    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1914  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1354 aa  656    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.662035  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2842  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.3 
 
 		 1295 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.97 
 
 		 1296 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0498  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  34.99 
 
 		 1295 aa  659    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1240  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.78 
 
 		 1293 aa  700    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4001  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.12 
 
 		 1299 aa  690    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00163478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1917  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.46 
 
 		 1361 aa  679    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.876478 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1858  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.33 
 
 		 1368 aa  642    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000230084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.53 
 
 		 1293 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2350  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  36.66 
 
 		 1293 aa  712    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1354  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.25 
 
 		 1298 aa  669    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2303  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  33.49 
 
 		 1356 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.874748  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3318  phosphoribosylformylglycinamidine synthase  35.3 
 
 		 1297 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>