46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0302 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0302  protein of unknown function DUF420  100 
 
 
178 aa  352  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00015964 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1664  hypothetical protein  73.45 
 
 
180 aa  260  6e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5678  protein of unknown function DUF420  47.65 
 
 
180 aa  147  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.856092  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2199  hypothetical protein  44.69 
 
 
181 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2397  hypothetical protein  39.33 
 
 
179 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.320338  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3020  protein of unknown function DUF420  44.83 
 
 
190 aa  137  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3820  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3480  hypothetical protein  38.2 
 
 
180 aa  135  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00378842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3771  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000019833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1482  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114475  hitchhiker  0.00174845 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3486  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3730  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.03907e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3850  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.041432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3466  hypothetical protein  38.2 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.837294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3568  hypothetical protein  38.2 
 
 
180 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3748  hypothetical protein  38.2 
 
 
179 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00364303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3463  protein of unknown function DUF420  42.26 
 
 
179 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0174815 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0516  protein of unknown function DUF420  44.69 
 
 
189 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01145  YozB  44.36 
 
 
178 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2222  hypothetical protein  42.66 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000232537  normal  0.200934 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  39.26 
 
 
444 aa  110  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0504  protein of unknown function DUF420  34.62 
 
 
187 aa  91.7  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0944  hypothetical protein  40.68 
 
 
143 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.977813  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2074  hypothetical protein  38.6 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143269  normal  0.730716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0947  protein of unknown function DUF420  38.14 
 
 
142 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0382908  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2325  hypothetical protein  35.07 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0949  protein of unknown function DUF420  37.29 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0898  hypothetical protein  37.29 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.17978  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2607  protein of unknown function DUF420  34.09 
 
 
145 aa  72  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0707  hypothetical protein  31.82 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0989  protein of unknown function DUF420  29.71 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1177  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1199  hypothetical protein  30.3 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1194  protein of unknown function DUF420  30.81 
 
 
200 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0410  hypothetical protein  30.22 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1860  protein of unknown function DUF420  29.46 
 
 
151 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2094  protein of unknown function DUF420  33.1 
 
 
188 aa  55.1  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.853374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0654  protein of unknown function DUF420  25.64 
 
 
220 aa  54.3  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.454771  normal  0.0604511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0671  protein of unknown function DUF420  28.57 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1474  protein of unknown function DUF420  29.61 
 
 
186 aa  52.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3296  protein of unknown function DUF420  30.43 
 
 
205 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0670  protein of unknown function DUF420  34.88 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1158  protein of unknown function DUF420  29.63 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0482662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2804  protein of unknown function DUF420  30.17 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2657  protein of unknown function DUF420  30.19 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2961  protein of unknown function DUF420  24.85 
 
 
220 aa  41.2  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>