21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3860 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  388  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  71.59 
 
 		 194 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  69.11 
 
 		 194 aa  250  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  68.09 
 
 		 188 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  70.45 
 
 		 194 aa  247  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  70.45 
 
 		 194 aa  247  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  62.3 
 
 		 195 aa  240  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  63.64 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  58.06 
 
 		 199 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  58.6 
 
 		 254 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  34.25 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  26.11 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  25.25 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  25.27 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  24.73 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  24.21 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  23.89 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2256  hypothetical protein  26.38 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2157  hypothetical protein  28.12 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.311546  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0695  hypothetical protein  23.71 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2026  type IV pilus assembly PilZ  31.82 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>