More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1987 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00894  DNA-binding membrane protein required for chromosome resolution and partitioning  84.63 
 
 
1342 aa  884    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  84.63 
 
 
1329 aa  884    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000229654  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1414  DNA translocase FtsK  61.45 
 
 
1244 aa  956    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0287873  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1074  DNA translocase FtsK  85.21 
 
 
1358 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.282682  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  59.09 
 
 
1310 aa  1384    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  0.0000000000551266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2050  DNA translocase FtsK  59.97 
 
 
917 aa  729    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000503772  hitchhiker  0.00152361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  87.33 
 
 
1157 aa  2017    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.4 
 
 
1202 aa  1465    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2438  DNA translocase FtsK  84.63 
 
 
1310 aa  884    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000385986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2483  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.59 
 
 
850 aa  712    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.000000825037 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2759  cell division protein FtsK  57.46 
 
 
879 aa  740    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2127  cell division protein FtsK/SpoIIIE  70.22 
 
 
837 aa  709    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000271124  normal  0.0651093 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.62 
 
 
896 aa  719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000146975  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  70.42 
 
 
911 aa  719    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0965  DNA translocase FtsK  84.63 
 
 
1368 aa  885    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000342338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.73 
 
 
866 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2323  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.96 
 
 
917 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000157277  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2230  DNA translocase FtsK  84.63 
 
 
1369 aa  885    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000123505  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2191  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.51 
 
 
917 aa  730    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000178712  normal  0.118465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1052  DNA translocase FtsK  84.44 
 
 
1342 aa  883    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000465717  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2156  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.51 
 
 
917 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000852872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0994  DNA translocase FtsK  85.21 
 
 
1360 aa  862    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.208263  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2233  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.88 
 
 
849 aa  709    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00175436  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1493  putative cell division protein FtsK  61.34 
 
 
960 aa  756    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121086  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1683  cell division protein FtsK/SpoIIIE  63.73 
 
 
1187 aa  1360    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.175033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2024  cell divisionFtsK/SpoIIIE  69.8 
 
 
841 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000111229  unclonable  0.00000274809 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01797  cell division protein FtsK  73.52 
 
 
1120 aa  767    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1662  DNA segregation ATPase FtsK  61.33 
 
 
855 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0615412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1025  DNA translocase FtsK  85.21 
 
 
1321 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.68582  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0995  DNA translocase FtsK  84.63 
 
 
1329 aa  884    Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.00000000000212407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  59.48 
 
 
1299 aa  1375    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1987  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
1145 aa  2335    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.252325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1743  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.98 
 
 
932 aa  734    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000155833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.09 
 
 
1174 aa  1441    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2436  DNA translocase FtsK  65.56 
 
 
1085 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.277561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2706  DNA translocase FtsK  84.63 
 
 
1329 aa  884    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00221849  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1772  cell division protein FtsK, putative  67.09 
 
 
928 aa  746    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00023204  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2460  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.55 
 
 
837 aa  698    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000438856  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.51 
 
 
917 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000327747  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1841  DNA translocase FtsK  73.33 
 
 
1091 aa  769    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.239685  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1186  DNA translocase FtsK  60.83 
 
 
903 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00816417  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1963  DNA translocase FtsK  60.55 
 
 
914 aa  725    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000218677  normal  0.918259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2013  DNA translocase FtsK  60.23 
 
 
913 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00817822  normal  0.0372318 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1795  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.38 
 
 
884 aa  716    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00936905  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003879  cell division protein FtsK  73.91 
 
 
1014 aa  765    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000123897  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0965  DNA translocase FtsK  85.21 
 
 
1360 aa  864    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.91 
 
 
1310 aa  1373    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1059  DNA translocase FtsK  85.21 
 
 
1379 aa  863    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00901  hypothetical protein  84.63 
 
 
1342 aa  884    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.71 
 
 
917 aa  635  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  0.00000000000948051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  62.9 
 
 
782 aa  633  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1730  hypothetical protein  62.4 
 
 
794 aa  629  1e-178  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.73 
 
 
789 aa  628  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  0.00000783388 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  62.01 
 
 
794 aa  625  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  63.36 
 
 
769 aa  620  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5663  DNA translocase FtsK  64.9 
 
 
1673 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.793927  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.52 
 
 
786 aa  620  1e-176  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  58.27 
 
 
777 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1344  hypothetical protein  64.23 
 
 
1851 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2089  cell division FtsK/SpoIIIE  55.68 
 
 
1369 aa  619  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.123454 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2240  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.69 
 
 
1610 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.751818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0976  cell division protein FtsK  64.43 
 
 
1784 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1193  DNA translocase FtsK  64.23 
 
 
1851 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2344  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.69 
 
 
1527 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0427458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  62.78 
 
 
786 aa  618  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.44 
 
 
908 aa  619  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.434451  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1596  DNA translocase FtsK  64.84 
 
 
1123 aa  616  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.262939  normal  0.732523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0956  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.08 
 
 
1707 aa  617  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.810802  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4578  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.44 
 
 
908 aa  619  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211608  normal  0.637963 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1709  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.69 
 
 
1527 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1712  DNA translocase FtsK  63.36 
 
 
789 aa  619  1e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475518  normal  0.695556 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.69 
 
 
1640 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2321  cell divisionFtsK/SpoIIIE  64.69 
 
 
1527 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.800211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3043  DNA translocase FtsK  62.04 
 
 
768 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.517068  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1032  putative cell division protein FtsK  64.23 
 
 
1725 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0718321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0835  putative cell division protein FtsK  64.23 
 
 
1725 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.816405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1924  cell division protein FtsK, putative  64.23 
 
 
1725 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28220  Cell division protein FtsK  63.75 
 
 
973 aa  614  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.41946  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1185  DNA translocase FtsK  64.23 
 
 
1834 aa  616  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2622  cell division protein FtsK  62.04 
 
 
768 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.436072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0315  putative cell division protein FtsK  64.23 
 
 
1725 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10146  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06128  DNA translocase FtsK  61.97 
 
 
786 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  58.42 
 
 
799 aa  614  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  61.97 
 
 
786 aa  615  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0835  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.16 
 
 
769 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  62.04 
 
 
768 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01655  hypothetical protein  63.6 
 
 
959 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.273957  normal  0.0637892 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3349  cell division protein FtsK  62.73 
 
 
801 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.293432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2122  cell division protein FtsK  62.04 
 
 
822 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204581  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  63.08 
 
 
801 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2388  DNA translocase FtsK  63.56 
 
 
802 aa  610  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0162583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3077  cell division ftsk transmembrane protein  62.04 
 
 
822 aa  612  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.737589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1243  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.29 
 
 
1485 aa  610  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.87 
 
 
821 aa  612  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  62.04 
 
 
822 aa  611  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1561  cell division protein FtsK  62.23 
 
 
819 aa  612  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0685  DNA translocase FtsK  61.99 
 
 
775 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579249  normal  0.40602 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0790  cell division protein FtsK  62.04 
 
 
822 aa  612  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  61.81 
 
 
776 aa  609  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  61.81 
 
 
776 aa  609  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>