More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0077 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0077  transposase  100 
 
 		 139 aa  286  7e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  56.03 
 
 		 259 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2704  transposase and inactivated derivative  43.2 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.905782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1222  transposase and inactivated derivative  43.2 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362267  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  45 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  45 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  45 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  45 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  45 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  40.29 
 
 		 255 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9115  transposase protein  41.38 
 
 		 125 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0549  hypothetical protein  40.52 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  44.83 
 
 		 260 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  40.29 
 
 		 260 aa  104  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  40.29 
 
 		 260 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  40.29 
 
 		 260 aa  103  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  44.83 
 
 		 260 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  44.83 
 
 		 260 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  44.83 
 
 		 260 aa  103  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  44.95 
 
 		 122 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  41.96 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1002  hypothetical protein  40.18 
 
 		 253 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0160346  normal  0.296217 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1612  hypothetical protein  40.18 
 
 		 253 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1798  hypothetical protein  40.18 
 
 		 253 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0976503  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6331  hypothetical protein  40.18 
 
 		 253 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  41.74 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4245  transposase and inactivated derivative  41.74 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  39.57 
 
 		 273 aa  100  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  41.88 
 
 		 115 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  42.73 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2632  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0421919  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4301  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.496479  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  50.55 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  50.55 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  50.55 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4382  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.490773  normal  0.725771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  42.2 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  39.02 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  39.02 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  39.02 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  40.91 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2122  IS298, transposase OrfA  41.82 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5016  hypothetical protein  40.16 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0903137 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6240  transposase IS5 family protein  36.36 
 
 		 253 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.879301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  39.86 
 
 		 251 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0214  transposase  43.56 
 
 		 106 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.35 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0046  IS298, transposase OrfA  39.2 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  40 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2018  IS298, transposase OrfA  39.2 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  40 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2649  IS298, transposase OrfA  38.4 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.96 
 
 		 281 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  37.4 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  38.18 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  38.18 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  41.38 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  41.38 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  37.5 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11060  transposase  38.94 
 
 		 135 aa  87  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.869155 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.51 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.51 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.51 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.51 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.51 
 
 		 254 aa  85.1  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40 
 
 		 252 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  35.77 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  41.46 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  41.46 
 
 		 122 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  37.93 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  37.93 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  36.15 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  40.83 
 
 		 122 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02613  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  39.32 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  37.59 
 
 		 142 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01188  hypothetical protein  31.33 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01770  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  34.04 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  34.04 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00289  transposase  31.33 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  34.04 
 
 		 254 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>