More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2694 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2694  ribosomal protein L31  100 
 
 		 69 aa  146  9e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000747794  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0823  ribosomal protein L31  67.69 
 
 		 73 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.013762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3107  50S ribosomal protein L31  72.31 
 
 		 65 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.938901  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0377  50S ribosomal protein L31  70.77 
 
 		 66 aa  103  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0028  50S ribosomal protein L31  63.77 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3712  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 73 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000169936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 72 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  65.62 
 
 		 68 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5786  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66710  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 71 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  70.31 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0322  ribosomal protein L31  64.18 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4064  50S ribosomal protein L31  66.15 
 
 		 65 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000459753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  64.62 
 
 		 121 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0724  50S ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0725  ribosomal protein L31  63.08 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 79 aa  96.7  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 79 aa  96.7  8e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0704  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0686  50S ribosomal protein L31  60.94 
 
 		 75 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  62.12 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3793  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  62.86 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  63.64 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45340  ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2084  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 74 aa  93.6  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000294546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0118  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  94  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2086  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 75 aa  93.6  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0399  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 73 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2982  50S ribosomal protein L31  62.32 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1472  50S ribosomal protein L31P  55.38 
 
 		 77 aa  92.8  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000025459  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1810  ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.731859  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3842  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0553  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03520  50S ribosomal subunit protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4027  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 74 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  92  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0498  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0501  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0477  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2301  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0537  50S ribosomal protein L31P  58.46 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4149  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 74 aa  91.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  60.87 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  62.32 
 
 		 76 aa  91.3  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 75 aa  90.9  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1235  ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 76 aa  90.9  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.803826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4788  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  90.9  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000702878 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  90.5  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  60.29 
 
 		 115 aa  90.5  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3874  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0952306 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3888  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3962  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 81 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.845671  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0170  50S ribosomal protein L31  58.46 
 
 		 71 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5136  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 75 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  58.21 
 
 		 71 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  65.15 
 
 		 72 aa  90.5  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6151  ribosomal protein L31  60 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.77799  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  61.76 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4960  ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29920  LSU ribosomal protein L31P  58.57 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.568534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3645  50S ribosomal protein L31  61.19 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  62.69 
 
 		 80 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5087  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4120  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5137  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3375  ribosomal protein L31  61.54 
 
 		 69 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00476029  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 71 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  56.52 
 
 		 82 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3776  50S ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653741  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  57.58 
 
 		 74 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  59.7 
 
 		 72 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0136  50S ribosomal protein L31P  58.57 
 
 		 69 aa  88.2  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000785169  normal  0.746727 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0447  50S ribosomal protein L31  53.62 
 
 		 70 aa  88.6  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19250  LSU ribosomal protein L31P  58.57 
 
 		 71 aa  87.8  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.464587  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  59.09 
 
 		 68 aa  87.8  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2306  50S ribosomal protein L31  58.57 
 
 		 70 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 71 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  60.61 
 
 		 73 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09910  LSU ribosomal protein L31P  56.52 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0118  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 71 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1786  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 69 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3811  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 71 aa  87.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4424  50S ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 70 aa  87.8  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4098  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 71 aa  87.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0184  50S ribosomal protein L31  55.38 
 
 		 71 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1060  ribosomal protein L31  57.97 
 
 		 71 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.431965  normal  0.787864 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3758  50S ribosomal protein L31  52.31 
 
 		 70 aa  87.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  56.92 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0381  50S ribosomal protein L31  52.17 
 
 		 70 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>