More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1723 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1723  putative sulfatase  100 
 
 
624 aa  1297    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010962  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2101  sulfatase  46.11 
 
 
614 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.102341  normal  0.0551221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52300  hypothetical protein  41.98 
 
 
642 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.640238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4586  hypothetical protein  41.71 
 
 
641 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445083  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0242  membrane associated sulfatase  30.67 
 
 
617 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0181  membrane associated sulfatase  30.67 
 
 
617 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3036  sulfatase  33.22 
 
 
611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2178  hypothetical protein  30.99 
 
 
622 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000141433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0352  sulfatase  29.12 
 
 
600 aa  260  6e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0469507  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3889  sulfatase  30.62 
 
 
613 aa  253  6e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2835  sulfatase  33.9 
 
 
625 aa  253  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.181831  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3482  sulfatase  32.46 
 
 
609 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531027  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03303  hypothetical protein  30.51 
 
 
607 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1271  hypothetical protein  28.96 
 
 
637 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002683  predicted hydrolase  28.96 
 
 
607 aa  233  8.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1272  hypothetical protein  27.98 
 
 
637 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2024  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  31.51 
 
 
638 aa  220  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0170  sulfatase  30.98 
 
 
635 aa  217  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2021  phosphoglycerol transferase MdoB-like protein, alkaline phosphatase superfamily  29.24 
 
 
647 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.886133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0173  sulfatase  29.24 
 
 
638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.317367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0014  sulfatase  29.03 
 
 
615 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2269  sulfatase  26.18 
 
 
595 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00312087  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0192  sulfatase  29.39 
 
 
630 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.30718 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2723  sulfatase family protein  28.37 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.223832  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2798  sulfatase  28.37 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000743938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1484  sulfatase family protein  28.37 
 
 
598 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.15625  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1626  hypothetical protein  27.29 
 
 
600 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000382415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0174  sulfatase  29.23 
 
 
621 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0183  sulfatase  28.91 
 
 
621 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3257  sulfatase  26.95 
 
 
593 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000874848  normal  0.913435 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0194  sulfatase  28.67 
 
 
621 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03028  hypothetical protein  26.68 
 
 
602 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002922  putative sulfatase  26.49 
 
 
602 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02118  predicted hydrolase, inner membrane  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0693117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1469  sulfatase  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00665277  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2338  sulfatase family protein  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0980627  normal  0.0832613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2327  sulfatase family protein  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.194972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02077  hypothetical protein  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0973017  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1459  sulfatase  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.741497  normal  0.82887 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3327  sulfatase family protein  26.95 
 
 
586 aa  157  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.388602  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2487  sulfatase family protein  26.95 
 
 
586 aa  157  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0306153  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0769  sulfatase family protein  26.95 
 
 
586 aa  156  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.442835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2447  sulfatase  28.01 
 
 
590 aa  154  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00465294  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1057  putative sulfatase  26.97 
 
 
601 aa  154  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2361  sulfatase  27.99 
 
 
590 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2219  sulfatase  26.57 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.198637  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2784  sulfatase  26.58 
 
 
586 aa  148  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.879948  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1903  sulfatase  27.16 
 
 
582 aa  147  5e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.959252  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2295  sulfatase  26.4 
 
 
596 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0407912  normal  0.745937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2428  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  26.4 
 
 
596 aa  146  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0457746  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1632  sulfatase  26.71 
 
 
582 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.258504  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2467  inner membrane protein YejM  25.75 
 
 
586 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.437197  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2579  inner membrane protein YejM  25.75 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal  0.0355426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2422  inner membrane protein YejM  25.75 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.223864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2465  hypothetical protein  25.75 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124553  hitchhiker  0.000929959 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2377  inner membrane protein YejM  25.75 
 
 
586 aa  140  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0230  hypothetical protein  23.28 
 
 
580 aa  134  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2175  hypothetical protein  25.55 
 
 
596 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2493  sulfatase  27.61 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0120701  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1815  sulfatase  26.34 
 
 
595 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000588334  normal  0.040327 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2651  sulfatase  25.84 
 
 
595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.131342  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2529  sulfatase  26.17 
 
 
595 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.370551  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2536  sulfatase  26.01 
 
 
595 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.120182  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2290  sulfatase  25.45 
 
 
592 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1470  sulfatase  27.25 
 
 
595 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00214736  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2337  sulfatase  25.84 
 
 
604 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000969509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1808  sulfatase  25.79 
 
 
594 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00146351  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2787  sulfatase  26.51 
 
 
595 aa  117  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00415644  normal  0.904543 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1555  hypothetical protein  23.74 
 
 
594 aa  107  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000146731  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1763  sulfatase  23.77 
 
 
594 aa  103  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2284  sulfatase  24.4 
 
 
784 aa  91.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1436  sulfatase  29.56 
 
 
481 aa  83.6  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314748  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3376  sulfatase  32.56 
 
 
509 aa  83.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0662  sulfatase  25.19 
 
 
630 aa  80.9  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  34.03 
 
 
516 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  34.03 
 
 
516 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  34.03 
 
 
516 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  34.53 
 
 
511 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  38.18 
 
 
516 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  33.09 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2507  sulfatase  27.59 
 
 
873 aa  75.5  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0936334  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1626  sulfatase  34.58 
 
 
476 aa  75.1  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.773199  normal  0.470838 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3253  sulfatase  37.96 
 
 
1065 aa  74.7  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.189767  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  39.42 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0237  sulfatase  27.8 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.813396  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1033  sulfatase domain-containing protein  22.46 
 
 
662 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198685  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  27.5 
 
 
537 aa  73.9  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  35.14 
 
 
515 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3685  sulfatase  27.82 
 
 
1009 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0329595  hitchhiker  0.00309505 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  35.14 
 
 
512 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  32.02 
 
 
457 aa  73.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  31.4 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  32.21 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  32.21 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  32.21 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  32.21 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  32.21 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  32.21 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  32.21 
 
 
517 aa  70.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1597  sulfatase  34.62 
 
 
522 aa  70.9  0.00000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00665248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>