28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0038 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0038  PUA domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  329  1e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1077  PUA domain-containing protein  59.31 
 
 		 149 aa  183  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0035  PUA domain-containing protein  62.84 
 
 		 152 aa  181  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00396797 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2144  PUA domain-containing protein  61.59 
 
 		 148 aa  177  7e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1534  PUA domain-containing protein  48.2 
 
 		 157 aa  127  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.305531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0570  archaeosine tRNA-ribosyltransferase  32.14 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0224275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1482  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.61 
 
 		 649 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2206  PUA domain-containing protein  32.37 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.141986  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1603  PUA domain-containing protein  37.33 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0996  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.41 
 
 		 649 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1632  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.97 
 
 		 649 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2533  PUA domain containing protein  32.35 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0869  hypothetical protein  30.77 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1348  hypothetical protein  29.93 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.39888  hitchhiker  0.0000845991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0878  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  29.8 
 
 		 652 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0282  7-cyano-7-deazaguanine tRNA-ribosyltransferase  26.32 
 
 		 649 aa  58.2  0.00000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0694  PUA domain-containing protein  29.2 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0631367  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0706  PUA domain-containing protein  32.89 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.924109  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1829  PUA domain-containing protein  30.07 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0798  PUA domain containing protein  29.66 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0663  PUA domain containing protein  38.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.830809  normal  0.0773964 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2275  hypothetical protein  24.82 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0665  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 		 376 aa  47.4  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.438806  normal  0.11367 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1685  PUA domain-containing protein  27.85 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.566422  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2748  PUA domain containing protein  33.33 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3182  PUA domain containing protein  30.52 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.636517  normal  0.0526175 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0226  PUA domain containing protein  31.2 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.102678  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0010  PUA domain-containing protein  31.71 
 
 		 377 aa  40.4  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.929374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>