More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0390 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  100 
 
 
422 aa  851    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  54.16 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  53.83 
 
 
422 aa  444  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  54.18 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  50.72 
 
 
428 aa  395  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  50.23 
 
 
443 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  50.62 
 
 
411 aa  360  2e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  38.32 
 
 
442 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.59 
 
 
424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  36.16 
 
 
428 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  33.56 
 
 
429 aa  239  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
428 aa  237  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  34.85 
 
 
429 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 
424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  36.87 
 
 
440 aa  233  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 
424 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
428 aa  226  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  34.1 
 
 
429 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  36.12 
 
 
424 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  35.6 
 
 
431 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
431 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  34.84 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
433 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
428 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  33.03 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  34.47 
 
 
457 aa  215  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  35.45 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  30.82 
 
 
408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  31.4 
 
 
424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  34.04 
 
 
425 aa  210  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  31.72 
 
 
459 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  30.75 
 
 
441 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  34.74 
 
 
434 aa  207  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  32.79 
 
 
432 aa  206  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  40.72 
 
 
425 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  30.59 
 
 
441 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  32.72 
 
 
431 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.48 
 
 
433 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.95 
 
 
426 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 
438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
422 aa  199  5e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  31.94 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  30.02 
 
 
404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3683  folylpolyglutamate synthetase  33.95 
 
 
416 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.03 
 
 
433 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  29.57 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  32.94 
 
 
427 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  30.09 
 
 
433 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  32.76 
 
 
426 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.16 
 
 
433 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  30.56 
 
 
433 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  31.77 
 
 
421 aa  193  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  31.78 
 
 
447 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.69 
 
 
434 aa  192  8e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  30.32 
 
 
433 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.69 
 
 
434 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.26 
 
 
422 aa  192  9e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.69 
 
 
434 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  34.55 
 
 
381 aa  191  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  30.32 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  30.32 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  30.32 
 
 
433 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  33.66 
 
 
416 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  30.09 
 
 
433 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2729  FolC bifunctional protein  33.66 
 
 
453 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1603  FolC bifunctional protein  33.64 
 
 
420 aa  188  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119279  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  32.01 
 
 
428 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  29.93 
 
 
433 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  28.54 
 
 
404 aa  187  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  33.95 
 
 
817 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  31.8 
 
 
437 aa  186  6e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  31.8 
 
 
435 aa  186  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  34.06 
 
 
437 aa  186  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2622  FolC bifunctional protein  30.32 
 
 
413 aa  186  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132417  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.05 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.53 
 
 
463 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  33.97 
 
 
439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  33.8 
 
 
441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  184  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  184  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  30.11 
 
 
465 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  33.9 
 
 
441 aa  183  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  30.7 
 
 
422 aa  182  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  30.73 
 
 
451 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  31.41 
 
 
422 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3492  FolC bifunctional protein  34.29 
 
 
444 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  31.41 
 
 
422 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  33.65 
 
 
438 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  31.41 
 
 
422 aa  181  2e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.69 
 
 
466 aa  181  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  30.53 
 
 
443 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  31.37 
 
 
431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0949  FolC bifunctional protein  34.02 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  31.14 
 
 
438 aa  180  2.9999999999999997e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1830  FolC bifunctional protein  32.86 
 
 
432 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0684286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>