23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04071 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04071  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 424 aa  882    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0594853  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1139  phage-related integrase  49.49 
 
 		 397 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0631  phage-related integrase  49.49 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  52.35 
 
 		 342 aa  339  7e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  24.13 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  23.62 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0555  hypothetical protein  24.77 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178247  normal  0.46728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  23.18 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  22.58 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  22.8 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  23.64 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  23.94 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  22.18 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  23.29 
 
 		 334 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  21.56 
 
 		 342 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  20.75 
 
 		 339 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  21.94 
 
 		 324 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.69 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  22.27 
 
 		 200 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  21.26 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  23.47 
 
 		 381 aa  43.9  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1734  phage integrase family protein  21.75 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155047 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  27.69 
 
 		 335 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>