More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5978 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  74.07 
 
 
452 aa  662  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  5.30916e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  100 
 
 
448 aa  905  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  69.42 
 
 
457 aa  635  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.79 
 
 
452 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.18 
 
 
449 aa  655  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.79 
 
 
452 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  679  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  82.96 
 
 
449 aa  762  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  679  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  71.62 
 
 
452 aa  678  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  79.1 
 
 
446 aa  724  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.79 
 
 
452 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.64 
 
 
451 aa  645  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  82.06 
 
 
449 aa  734  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  678  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.75 
 
 
483 aa  662  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.1 
 
 
450 aa  663  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  679  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  82.96 
 
 
449 aa  764  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.79 
 
 
452 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  73.61 
 
 
454 aa  640  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.64 
 
 
449 aa  650  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  8.7639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  70.31 
 
 
450 aa  659  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  679  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  72.1 
 
 
455 aa  646  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  678  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  98.66 
 
 
448 aa  894  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  678  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.79 
 
 
452 aa  677  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.56 
 
 
450 aa  641  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  71.62 
 
 
452 aa  678  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  73.56 
 
 
449 aa  669  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  62.67 
 
 
445 aa  583  1e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  63.55 
 
 
449 aa  575  1e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  63.04 
 
 
449 aa  575  1e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  3.67094e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  63.35 
 
 
449 aa  574  1e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  63.04 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  63.55 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  63.27 
 
 
449 aa  572  1e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.91973e-08  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  64.06 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  63.55 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  2.15527e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  63.33 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70433e-14 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  63.33 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  64.29 
 
 
449 aa  573  1e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.64698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  55.77 
 
 
481 aa  540  1e-152  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.1877e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  59.42 
 
 
452 aa  530  1e-149  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  56.48 
 
 
448 aa  521  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  59.55 
 
 
452 aa  515  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  1.12087e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  59.55 
 
 
452 aa  515  1e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0222  glycerol-3-phosphate transporter  46.7 
 
 
445 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0222  glycerol-3-phosphate transporter  46.7 
 
 
445 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.493626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  44.32 
 
 
444 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  43.86 
 
 
444 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  43.86 
 
 
444 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  43.86 
 
 
444 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  44.29 
 
 
446 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  44.32 
 
 
444 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  43.64 
 
 
444 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  43.5 
 
 
444 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  43.86 
 
 
444 aa  373  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  44.09 
 
 
444 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  43.61 
 
 
444 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  39.2 
 
 
446 aa  314  2e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  38.74 
 
 
463 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  38.74 
 
 
463 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  38.74 
 
 
463 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  38.74 
 
 
463 aa  308  1e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  38.74 
 
 
463 aa  308  1e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1436  glycerol-3-phosphate transporter, putative  38.46 
 
 
457 aa  306  5e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000217705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  42.99 
 
 
456 aa  304  2e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  38.11 
 
 
439 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  38.11 
 
 
439 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  38.11 
 
 
439 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  38.11 
 
 
439 aa  276  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.47751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  38.11 
 
 
439 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  38.11 
 
 
439 aa  276  8e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  38.11 
 
 
439 aa  276  8e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  38.11 
 
 
439 aa  276  8e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  38.58 
 
 
455 aa  275  1e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  37.88 
 
 
439 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  38.58 
 
 
455 aa  273  5e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  35.2 
 
 
443 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  39.03 
 
 
442 aa  266  5e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  38.8 
 
 
442 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  38.8 
 
 
442 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  38.8 
 
 
442 aa  265  9e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  38.8 
 
 
442 aa  263  5e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  35.44 
 
 
443 aa  263  5e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  35.44 
 
 
443 aa  263  6e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  35.68 
 
 
453 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  36.44 
 
 
442 aa  259  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3502  regulatory protein UhpC  36.64 
 
 
447 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 
441 aa  246  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
446 aa  246  7e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  33.82 
 
 
433 aa  233  7e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  33.81 
 
 
436 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1684  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 
422 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.597788  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  33.66 
 
 
434 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0640  major facilitator transporter  30.37 
 
 
480 aa  219  8e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0187826  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  33.75 
 
 
440 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.186527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>