More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2957 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  100 
 
 
364 aa  748    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  98.63 
 
 
364 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  63.06 
 
 
367 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  61.5 
 
 
382 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  62.05 
 
 
365 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  61.77 
 
 
365 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  48.21 
 
 
371 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  47.35 
 
 
368 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  48.76 
 
 
389 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 
373 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  45.56 
 
 
381 aa  311  1e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  44.9 
 
 
369 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  44.81 
 
 
373 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  43.96 
 
 
363 aa  303  2.0000000000000002e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
364 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  44.2 
 
 
368 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  41.58 
 
 
381 aa  282  7.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
396 aa  280  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  40.83 
 
 
429 aa  275  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  59.56 
 
 
194 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
154 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  46.15 
 
 
158 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  39.43 
 
 
188 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
178 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  43.79 
 
 
171 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
170 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
154 aa  106  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 
146 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  47.89 
 
 
164 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  45.64 
 
 
168 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  33.33 
 
 
367 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  46.48 
 
 
159 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
162 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.67 
 
 
152 aa  87.8  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
153 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.89 
 
 
153 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  31.22 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  42.42 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.55 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.72 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.97 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  35.92 
 
 
142 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.59 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  28.76 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.16 
 
 
150 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.29 
 
 
159 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.94 
 
 
175 aa  64.3  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.29 
 
 
147 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  63.5  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.53 
 
 
151 aa  62  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.14 
 
 
154 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0304  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
143 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0312411  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.67 
 
 
154 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.45 
 
 
147 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.47 
 
 
139 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.17 
 
 
160 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1724  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.37 
 
 
160 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.1 
 
 
189 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  33.57 
 
 
138 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.78 
 
 
152 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 
157 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.54 
 
 
147 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.51 
 
 
150 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.2 
 
 
153 aa  60.5  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
167 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.85 
 
 
150 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.67 
 
 
165 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1867  ribosomal protein (S18)-alanine acetyltransferase  29.71 
 
 
150 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.216572  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  47.76 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.94 
 
 
162 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
142 aa  59.3  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.76 
 
 
160 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.86 
 
 
148 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  32.14 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
145 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
139 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
166 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.12 
 
 
150 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
160 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
163 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  47.76 
 
 
147 aa  57.4  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.27 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.27 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.27 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.27 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  46.27 
 
 
98 aa  57.4  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>