226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1239 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1239  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 252 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.668505  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1269  beta-lactamase domain-containing protein  99.21 
 
 		 252 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.914297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4179  beta-lactamase domain-containing protein  98.41 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562298 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3973  beta-lactamase domain-containing protein  94.84 
 
 		 252 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1550  Beta-lactamase-like  80.95 
 
 		 252 aa  425  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294376  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3951  metallo-beta-lactamase superfamily protein  80.56 
 
 		 252 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00829584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1373  Beta-lactamase-like  77.08 
 
 		 253 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51250  hypothetical protein  66.67 
 
 		 252 aa  339  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188489 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4385  hypothetical protein  66.1 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2814  beta-lactamase-like protein  48.22 
 
 		 263 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1139  Beta-lactamase-like  44.49 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000269692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  47.01 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0841  beta-lactamase-like protein  45.31 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000232036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0985  beta-lactamase-like protein  45.31 
 
 		 257 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000377257  normal  0.567685 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2111  beta-lactamase domain-containing protein  47.24 
 
 		 258 aa  211  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.234002  hitchhiker  0.00376892 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0848  Beta-lactamase-like  44.27 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.701692  hitchhiker  0.00132369 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5984  beta-lactamase-like  47.24 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2093  beta-lactamase domain-containing protein  47.24 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.204036  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2546  beta-lactamase domain protein  44.19 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102753  normal  0.0179239 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2620  beta-lactamase-like  46.48 
 
 		 258 aa  208  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0431697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1587  putative metallo-beta-lactamase family protein  43.41 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2003  beta-lactamase domain-containing protein  46.85 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.645635  hitchhiker  0.0000000218152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2130  beta-lactamase domain-containing protein  46.85 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.163194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1181  beta-lactamase domain-containing protein  46.46 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0988621  hitchhiker  0.00000250799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0408  hypothetical protein  42.05 
 
 		 254 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5399  Beta-lactamase-like  45.28 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00646528  normal  0.27837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1425  beta-lactamase domain-containing protein  43.92 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101426  normal  0.203136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1106  Beta-lactamase-like  45.56 
 
 		 262 aa  198  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1100  hypothetical protein  45.1 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.947825  normal  0.67239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2565  hypothetical protein  45.49 
 
 		 255 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.601531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1070  beta-lactamase-like protein  42.47 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.941364 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1147  hypothetical protein  43.63 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.385681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1085  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0472952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0989  beta-lactamase domain protein  42.58 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.183527  normal  0.269998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1008  beta-lactamase domain-containing protein  43.58 
 
 		 260 aa  191  8e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0922  beta-lactamase domain protein  43.58 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3434  beta-lactamase domain protein  42.02 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1676  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2696  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.997916  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2178  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0850031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2617  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1451  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.175509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2563  metallo-beta-lactamase family protein  44.31 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.460809  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3139  metallo-beta-lactamase family protein  43.63 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.904093  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3172  beta-lactamase-like  40.86 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1335  beta-lactamase domain-containing protein  39.22 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1908  metallo-beta-lactamase family protein  44.53 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.952512  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1329  beta-lactamase superfamily hydrolase  40.79 
 
 		 256 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1236  beta-lactamase domain-containing protein  44.49 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3027  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1631  metallo-beta-lactamase family protein  41.91 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0446531  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2799  beta-lactamase domain-containing protein  39.3 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00920301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2782  beta-lactamase domain protein  37.85 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.492368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0745  beta-lactamase domain protein  41.78 
 
 		 265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2327  beta-lactamase-like protein  37.02 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000211578  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20260  beta-lactamase domain protein  40.44 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1895  beta-lactamase domain-containing protein  37.8 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2153  beta-lactamase domain-containing protein  36.61 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1194  beta-lactamase domain-containing protein  39.83 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.598538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0232  beta-lactamase domain protein  35.12 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2063  beta-lactamase domain-containing protein  38.4 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3811  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2896  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0648  beta-lactamase domain protein  36.22 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3388  beta-lactamase domain protein  37.29 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1050  beta-lactamase domain protein  36.89 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2313  beta-lactamase domain-containing protein  36.86 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00657637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0966  beta-lactamase domain-containing protein  41.52 
 
 		 278 aa  155  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.779682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2334  beta-lactamase domain protein  38.59 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.577131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1944  Beta-lactamase-like  35.83 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3534  beta-lactamase domain protein  35.32 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4997  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101352  normal  0.026675 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1886  beta-lactamase domain protein  38.17 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2443  hypothetical protein  34.87 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3405  beta-lactamase domain protein  33.05 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0106326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5255  beta-lactamase domain-containing protein  33.62 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2693  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.552657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4002  beta-lactamase domain-containing protein  34.04 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5611  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5646  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0604366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5585  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1144  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5350  metallo-beta-lactamase family protein  33.62 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000218111  hitchhiker  0.00000000000000228298 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5315  metallo-beta-lactamase family protein  33.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5143  zinc-dependent hydrolase  33.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5159  metallo-beta-lactamase family protein  33.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5711  metallo-beta-lactamase family protein  33.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5568  metallo-beta-lactamase family protein  33.19 
 
 		 264 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.62183e-37 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2530  metallo-beta-lactamase family protein YycJ  30.74 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.22966  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0022  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0022  beta-lactamase domain-containing protein  31.75 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2918  beta-lactamase domain protein  38.43 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4916  beta-lactamase domain protein  33.74 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2932  metallo-beta-lactamase family protein  30.25 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2615  metallo-beta-lactamase family protein  30.13 
 
 		 263 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0721  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.33 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2881  beta-lactamase-like  34.76 
 
 		 285 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.252377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  35.29 
 
 		 265 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0023  beta-lactamase domain-containing protein  33.48 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2644  beta-lactamase domain protein  32.89 
 
 		 256 aa  135  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>