149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0405 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0405  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 339 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0439  aminoglycoside phosphotransferase  99.41 
 
 		 339 aa  689    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0436  aminoglycoside phosphotransferase  96.17 
 
 		 339 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4797  aminoglycoside phosphotransferase  89.38 
 
 		 339 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.318668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5131  aminoglycoside phosphotransferase  75.22 
 
 		 339 aa  534  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.552611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0555  hypothetical protein  73.16 
 
 		 341 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4623  aminoglycoside phosphotransferase  74.25 
 
 		 340 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111315  normal  0.973044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4009  aminoglycoside phosphotransferase  75.08 
 
 		 341 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07780  hypothetical protein  66.27 
 
 		 338 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0103434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46790  phosphotransferase  70.03 
 
 		 340 aa  452  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0740  hypothetical protein  65.37 
 
 		 338 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.565611  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2148  aminoglycoside phosphotransferase  53.5 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0514  hypothetical protein  49.42 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0621374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0390  aminoglycoside phosphotransferase  49.43 
 
 		 357 aa  311  9e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0405  aminoglycoside phosphotransferase  49.14 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0496  aminoglycoside phosphotransferase  48.38 
 
 		 344 aa  308  8e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0550103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0126  aminoglycoside phosphotransferase  47.62 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2630  aminoglycoside phosphotransferase  47.81 
 
 		 349 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280943  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2336  hypothetical protein  49.37 
 
 		 330 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0198  aminoglycoside phosphotransferase  49.08 
 
 		 336 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.159421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2764  aminoglycoside phosphotransferase  47.52 
 
 		 349 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3660  aminoglycoside phosphotransferase  49.35 
 
 		 341 aa  300  3e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6039  aminoglycoside phosphotransferase  46.92 
 
 		 349 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0435  aminoglycoside phosphotransferase  45.77 
 
 		 348 aa  299  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625762  normal  0.267382 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2100  aminoglycoside phosphotransferase  46.92 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2712  aminoglycoside phosphotransferase  46.92 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2739  aminoglycoside phosphotransferase  47.51 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0587  aminoglycoside phosphotransferase  47.92 
 
 		 348 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0574  hypothetical protein  46.9 
 
 		 401 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1871  aminoglycoside phosphotransferase  48.67 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0395  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410154  normal  0.0724183 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0870  phosphotransferase domain-containing protein  47.35 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0691  phosphotransferase family protein  47.2 
 
 		 344 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0600  hypothetical protein  50.86 
 
 		 341 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0207  hypothetical protein  47.2 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2738  phosphotransferase family protein  47.2 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2340  phosphotransferase family protein  47.2 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0705  phosphotransferase family protein  47.2 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2420  phosphotransferase family protein  47.2 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1645  aminoglycoside phosphotransferase  51.01 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.260839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0099  aminoglycoside phosphotransferase  45.97 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1715  hypothetical protein  50.67 
 
 		 368 aa  279  4e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0351551  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02246  aminoglycoside phosphotransferase  48.16 
 
 		 339 aa  279  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1575  aminoglycoside phosphotransferase  43.94 
 
 		 333 aa  278  9e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.775412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4025  hypothetical protein  44.07 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4113  aminoglycoside phosphotransferase  50 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.567269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0674  aminoglycoside phosphotransferase  45.35 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3471  aminoglycoside phosphotransferase  49.68 
 
 		 387 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.161527  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5276  aminoglycoside phosphotransferase  46.81 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1453  aminoglycoside phosphotransferase  44.51 
 
 		 346 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.355309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2432  aminoglycoside phosphotransferase  52.38 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4765  aminoglycoside phosphotransferase  47.84 
 
 		 372 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.476513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0201  hypothetical protein  47.27 
 
 		 350 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3910  aminoglycoside phosphotransferase  44.51 
 
 		 393 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1019  aminoglycoside phosphotransferase  51.94 
 
 		 341 aa  260  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6036  aminoglycoside phosphotransferase  45.71 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4077  aminoglycoside phosphotransferase  46.84 
 
 		 360 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4864  aminoglycoside phosphotransferase  43.55 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0976  aminoglycoside phosphotransferase  46.58 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244351  normal  0.0781282 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4813  aminoglycoside phosphotransferase  44.34 
 
 		 333 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0654401 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1653  aminoglycoside phosphotransferase  42.17 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3511  aminoglycoside phosphotransferase  44.12 
 
 		 346 aa  242  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0107  phosphotransferase enzyme family protein  39.33 
 
 		 329 aa  232  7.000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0251717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2075  7.5 kDa chlorosome protein  39.33 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.978302  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0883  aminoglycoside phosphotransferase  38.91 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000858674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0968  aminoglycoside phosphotransferase  38.53 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0389824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0993  aminoglycoside phosphotransferase  40.48 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3111  aminoglycoside phosphotransferase  41.08 
 
 		 363 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.034337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3635  phosphotransferase  38.94 
 
 		 351 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1018  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.264433  normal  0.0137892 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0981  aminoglycoside phosphotransferase  37.15 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125929  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1083  aminoglycoside phosphotransferase  37.46 
 
 		 361 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0965455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1050  aminoglycoside phosphotransferase  37.24 
 
 		 361 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00944447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3308  aminoglycoside phosphotransferase  37.74 
 
 		 347 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.346966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1753  aminoglycoside phosphotransferase  41.84 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000733825 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0349  hypothetical protein  39.55 
 
 		 325 aa  216  5.9999999999999996e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0866  aminoglycoside phosphotransferase  36.61 
 
 		 348 aa  215  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000878468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2815  phosphotransferase  39 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.6508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0741  hypothetical protein  36.47 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1518  hypothetical protein  35.06 
 
 		 379 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.422445 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0909  aminoglycoside phosphotransferase  40.14 
 
 		 363 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00179002  normal  0.193933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3205  aminoglycoside phosphotransferase  39.8 
 
 		 363 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00746028  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0374  hypothetical protein  38.59 
 
 		 325 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0962  aminoglycoside phosphotransferase  41.31 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.135258  hitchhiker  0.0017288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1697  aminoglycoside phosphotransferase  37.41 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3417  aminoglycoside phosphotransferase  39.8 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.118302  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0916  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.318568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2072  aminoglycoside phosphotransferase  33.77 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3075  aminoglycoside phosphotransferase  35.81 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0296  aminoglycoside phosphotransferase  39.26 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.000010357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2884  aminoglycoside phosphotransferase  33.53 
 
 		 379 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3033  phosphotransferase, putative  37.58 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2642  aminoglycoside phosphotransferase  37.58 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.365504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3437  aminoglycoside phosphotransferase  36.09 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17769  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2299  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 		 328 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.45511  normal  0.057046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2000  aminoglycoside phosphotransferase  36.15 
 
 		 327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00692225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2677  aminoglycoside phosphotransferase  38.59 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0081  protein of unknown function UPF0079  34.06 
 
 		 506 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.428182  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0625  hypothetical protein  34.69 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00759808  normal  0.677515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0566  aminoglycoside phosphotransferase  34.43 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>