118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2034 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2034  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 330 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2334  Bile acid:sodium symporter  95.44 
 
 		 329 aa  590  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.87771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2144  Bile acid:sodium symporter  90.94 
 
 		 333 aa  555  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1906  Bile acid:sodium symporter  86.02 
 
 		 331 aa  543  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1880  putative sodium/bile acid symporter family protein  85.54 
 
 		 342 aa  501  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2266  putative sodium/bile acid symporter family protein  85.85 
 
 		 342 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1994  hypothetical protein  85.85 
 
 		 342 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2250  hypothetical protein  80 
 
 		 332 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002288 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2770  sodium:bile acid symporter family protein  67.82 
 
 		 332 aa  397  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02309  predicted inner membrane protein  67.51 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000832535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1252  Bile acid:sodium symporter  67.51 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000190028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02270  hypothetical protein  67.51 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000838069  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2544  bile acid/Na+ symporter family protein  67.51 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000983747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2697  bile acid/Na+ symporter family protein  67.82 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000209356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1269  bile acid:sodium symporter  67.51 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000908139  hitchhiker  0.000128844 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2565  bile acid/Na+ symporter family protein  67.82 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000897855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3641  sodium:bile acid symporter family protein  67.82 
 
 		 332 aa  397  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000261961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2684  bile acid/Na+ symporter family transporter  65.93 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.68374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2660  transporter bile acid/Na+ symporter family  66.25 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2569  transporter, bile acid/Na+ symporter family  66.25 
 
 		 332 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000515206  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2618  bile acid/Na+ symporter family protein  66.25 
 
 		 332 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2790  bile acid/Na+ symporter family transporter  65.93 
 
 		 332 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2937  bile acid:sodium symporter  65.4 
 
 		 331 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.120648 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3442  bile acid:sodium symporter  66.67 
 
 		 330 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176045  hitchhiker  0.000533491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3177  bile acid:sodium symporter  58.26 
 
 		 347 aa  359  3e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.98524  normal  0.0121029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3262  hypothetical protein  59.81 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3465  bile acid:sodium symporter  56.4 
 
 		 348 aa  349  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.440703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0321  Bile acid:sodium symporter  59.43 
 
 		 323 aa  348  6e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38320  bile acid/Na+ symporter family transporter  59.81 
 
 		 333 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2484  bile acid:sodium symporter  56.73 
 
 		 331 aa  345  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.846841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04030  bile acid/sodium symporter  54.01 
 
 		 334 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3402  hypothetical protein  57.99 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.431314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2738  hypothetical protein  57.99 
 
 		 329 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.889143  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3390  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3064  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2029  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0339  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2255  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 346 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0532  sodium/bile acid symporter family protein  57.23 
 
 		 382 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180228  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0352  sodium/bile acid symporter family protein  56.71 
 
 		 346 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.446247  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0302  sodium/bile acid symporter family protein  57.8 
 
 		 394 aa  335  9e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3320  Bile acid:sodium symporter  53.82 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3619  Bile acid:sodium symporter  53.82 
 
 		 344 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2965  bile acid:sodium symporter  58.04 
 
 		 343 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2904  bile acid:sodium symporter  56.7 
 
 		 334 aa  328  6e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.731183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3017  bile acid:sodium symporter  56.57 
 
 		 347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5029  hypothetical protein  53.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2501  bile acid:sodium symporter  55.14 
 
 		 324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2880  bile acid:sodium symporter  57.73 
 
 		 347 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2356  bile acid:sodium symporter  56.4 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2970  bile acid:sodium symporter  56.4 
 
 		 343 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6319  bile acid/sodium symporter  57.41 
 
 		 343 aa  323  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2990  bile acid:sodium symporter  57.41 
 
 		 343 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4465  bile acid:sodium symporter  58.57 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0112  hypothetical protein  52.09 
 
 		 328 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0657186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2382  bile acid:sodium symporter  56.39 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2812  bile acid:sodium symporter  56.56 
 
 		 333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.885659  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2877  bile acid/Na+ symporter family protein  57.46 
 
 		 333 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0152  bile acid:sodium symporter  56.47 
 
 		 340 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.20925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4937  Bile acid:sodium symporter  52.06 
 
 		 335 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0427  Bile acid:sodium symporter  57.1 
 
 		 342 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.866752 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3255  bile acid:sodium symporter  57.1 
 
 		 332 aa  311  9e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4282  putative sodium/bile acid symporter family protein  56.47 
 
 		 342 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.175014 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2148  bile acid:sodium symporter  52.32 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2714  bile acid:sodium symporter  50.15 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.476045  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1064  sodium/bile acid symporter family protein  52.06 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1029  sodium/bile acid symporter family protein  52.06 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3716  Bile acid:sodium symporter  50.16 
 
 		 343 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0440669 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0139  hypothetical protein  49.38 
 
 		 326 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0525  bile acid:sodium symporter  48.12 
 
 		 336 aa  287  2e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1098  bile acid:sodium symporter  49.21 
 
 		 336 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.981697  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0247  bile acid:sodium symporter  50.31 
 
 		 324 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0866  bile acid:sodium symporter  49.54 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.964069  normal  0.299881 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0527  hypothetical protein  44.83 
 
 		 363 aa  275  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000523356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2484  bile acid:sodium symporter  46.54 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.284228  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2813  Bile acid:sodium symporter  43.96 
 
 		 343 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0326  Bile acid:sodium symporter  44.73 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0453748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4216  Bile acid:sodium symporter  46.42 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2407  Bile acid:sodium symporter  43.3 
 
 		 343 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2538  lipoprotein transmembrane  43.73 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4379  bile acid:sodium symporter  47.81 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1364  hypothetical protein  43.29 
 
 		 340 aa  259  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.953103  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0585  lipoprotein transmembrane  43.49 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0807  Bile acid:sodium symporter  43.9 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.308554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17200  predicted Na+-dependent transporter  47.59 
 
 		 328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4831  putative symporter family protein  45.6 
 
 		 332 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3572  hypothetical protein  51.94 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3613  bile acid:sodium symporter  42.5 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423949  hitchhiker  0.00964207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2649  bile acid:sodium symporter  50.99 
 
 		 335 aa  243  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4204  bile acid:sodium symporter  46.62 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2427  bile acid:sodium symporter  39.46 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0574524  normal  0.0414588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3818  bile acid:sodium symporter  40.31 
 
 		 332 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.530909  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0648  transporter, putative  40.8 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3205  Bile acid:sodium symporter  41.5 
 
 		 328 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2103  Bile acid:sodium symporter  38.53 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1125  Bile acid:sodium symporter  40.85 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0747  transporter, putative  41.1 
 
 		 342 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0909  transporter, sodium/bile acid symporter family  41.32 
 
 		 326 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.582064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3906  bile acid:sodium symporter  36.89 
 
 		 378 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1899  Bile acid:sodium symporter  35.08 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>