58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1677 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1677  glycosyl transferase family 8  100 
 
 		 610 aa  1261    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1675  glycosyl transferase family 8  51.32 
 
 		 602 aa  598  1e-169  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1676  glycosyl transferase family 8  50.36 
 
 		 615 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2255  glycosyl transferase family 8  27.02 
 
 		 283 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0672322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2193  glycosyl transferase family 8  26.61 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1098  glycosyl transferase family protein  24.64 
 
 		 278 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0504909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3683  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 334 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0415394  normal  0.880044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0700  glycosyl transferase family 8  24.12 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000278509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1397  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1009  glycosyl transferase family 8  27.39 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.219691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2994  glycosyl transferase family 8  26.82 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.162818  normal  0.206335 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3427  lipopolysaccharide 1  27.24 
 
 		 342 aa  63.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2733  glycosyl transferase family 8  31.51 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5876  glycosyl transferase family 8  25.99 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00913304  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1294  glycosyl transferase family 8  28.04 
 
 		 280 aa  59.3  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1821  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.192884  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1329  glycosyl transferase family 8  27.33 
 
 		 276 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4053  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  28.31 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4129  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  28.31 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0229706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0950  lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.23 
 
 		 274 aa  55.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2963  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 319 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0383599 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3963  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.94 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3837  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  27.94 
 
 		 331 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000031402  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0082  lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  28.25 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.313803  hitchhiker  0.00265615 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5779  glycosyl transferase family 8  25 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149079 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2061  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0812  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 		 272 aa  52.8  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4377  Lipopolysaccharide 3-alpha-galactosyltransferase  23.13 
 
 		 336 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0451  glycosyl transferase family 8  27.89 
 
 		 275 aa  52  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0083  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  27.57 
 
 		 331 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.110554  hitchhiker  0.00261992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1382  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 316 aa  50.8  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1459  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 413 aa  50.8  0.00007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0416  glycosyl transferase family 8  22.05 
 
 		 273 aa  50.4  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0936  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 282 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0365621  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03486  UDP-glucose:(Glucosyl) LPS alpha1,3-glucosyltransferase WaaO  24.15 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  25.16 
 
 		 697 aa  49.7  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03438  hypothetical protein  24.15 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4130  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  24.15 
 
 		 338 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00481358  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4104  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  24.25 
 
 		 337 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44760  Lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.98 
 
 		 326 aa  48.9  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0167  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 318 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4000  hypothetical protein  29.45 
 
 		 326 aa  47.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3964  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.32 
 
 		 338 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1515  hypothetical protein  29.86 
 
 		 318 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4054  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  23.4 
 
 		 338 aa  47  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03434  hypothetical protein  35.19 
 
 		 163 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3838  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  23.08 
 
 		 338 aa  45.8  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000851053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0617  glycosyl transferase family 8  28.19 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.170905  normal  0.336264 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0079  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  24.16 
 
 		 338 aa  45.4  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4999  lipopolysaccharide 1,3-galactosyltransferase  27.75 
 
 		 335 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0636  glycosyltransferase family 8 lipopolysaccharide biosynthesis protein  22.52 
 
 		 354 aa  44.7  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0133438  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4378  Lipopolysaccharide glucosyltransferase I  26.85 
 
 		 336 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.993607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3961  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  24.06 
 
 		 342 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0769884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3835  lipopolysaccharide 1,2-galactosyltransferase  24.06 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000101924  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0085  lipopolysaccharide glucosyltransferase I  24.06 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.416805  normal  0.0154654 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03432  hypothetical protein  27.75 
 
 		 341 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.442893  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03481  UDP-galactose:(Galactosyl) LPS alpha1,2-galactosyltransferase  27.75 
 
 		 341 aa  44.3  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.635685  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3935  lipopolysaccharide 1,2-glucosyltransferase  23.13 
 
 		 336 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>