88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0031 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0031  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  165  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0036  protein of unknown function DUF1471  94.12 
 
 		 85 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0022  hypothetical protein  71.76 
 
 		 85 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0028  protein of unknown function DUF1471  70.24 
 
 		 85 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.20234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1595  hypothetical protein  56.47 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1779  hypothetical protein  56.47 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.23903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1488  hypothetical protein  56.47 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3924  protein of unknown function DUF1471  55.95 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4110  protein of unknown function DUF1471  61.9 
 
 		 85 aa  87.8  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1291  hypothetical protein  51.76 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0900385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1235  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2489  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17858  hitchhiker  0.000290126 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2014  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221755 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1234  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.124074  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1492  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0142417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01116  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01108  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2535  protein of unknown function DUF1471  48.24 
 
 		 85 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0283942  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00786  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00769  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2841  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.907908  normal  0.0578067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0826  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0887  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0951  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0972  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0860  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0919  hypothetical protein  57.65 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2840  protein of unknown function DUF1471  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0870  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0857  hypothetical protein  52.94 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1627  hypothetical protein  48.24 
 
 		 85 aa  67.4  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.884329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1290  protein YcfR  46.51 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0951  hypothetical protein  51.76 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1844  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2131  protein of unknown function DUF1471  42.35 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1971  protein YcfR  46.51 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1328  hypothetical protein  46.51 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000844742 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0707  protein of unknown function DUF1471  50.59 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1313  hypothetical protein  46.51 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000232038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4121  protein of unknown function DUF1471  46.59 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0739  protein of unknown function DUF1471  50 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4435  hypothetical protein  41.86 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2155  hypothetical protein  45.35 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000201549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3536  protein of unknown function DUF1471  42.68 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.177081  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0034  protein of unknown function DUF1471  47.67 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4128  protein of unknown function DUF1471  43.18 
 
 		 88 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0830  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.324676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0861  hypothetical protein  42.35 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.255089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2544  hypothetical protein  42.35 
 
 		 134 aa  60.1  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00773  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00790  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0955  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0818047  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2836  protein of unknown function DUF1471  42.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.680807  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2837  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.289732  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2550  hypothetical protein  54.79 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3695  protein of unknown function DUF1471  41.18 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.648566  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0875  hypothetical protein  42.35 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0913603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1392  hypothetical protein  52.33 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03098  hypothetical protein  38.37 
 
 		 87 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0468  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.291673 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0468  protein of unknown function DUF1471  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3534  protein YcfR  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.780594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3538  protein YcfR  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3427  protein YcfR  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.928315  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4555  protein YcfR  36.78 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.421105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3721  protein YcfR  37.21 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3553  protein YhcN  37.65 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3624  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.392206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3674  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3552  protein YhcN  36.05 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3659  hypothetical protein  36.05 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0056  protein of unknown function DUF1471  49.41 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3721  hypothetical protein  37.21 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.344064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1393  hypothetical protein  50.59 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0466  hypothetical protein  37.04 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000249434  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0102  protein of unknown function DUF1471  47.56 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3660  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.332792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3554  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.563854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4082  hypothetical protein  38.27 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.714562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3553  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3722  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.414513 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3625  hypothetical protein  35.63 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.266928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2648  hypothetical protein  50.59 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000158517  hitchhiker  0.000000615567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3673  hypothetical protein  30.23 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0467  hypothetical protein  33.72 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000103446  normal  0.799705 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3618  hypothetical protein  28.24 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3969  hypothetical protein  28.24 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.206164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3763  hypothetical protein  28.24 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0643388  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>