39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_66880 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  273  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  94.93 
 
 		 138 aa  260  6e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  64.03 
 
 		 140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  59.46 
 
 		 148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  58.7 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  57.97 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  57.97 
 
 		 139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  56.52 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  55.47 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  43.17 
 
 		 284 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  42.96 
 
 		 257 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  43.28 
 
 		 292 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  41.18 
 
 		 230 aa  103  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.69 
 
 		 261 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.69 
 
 		 258 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.93 
 
 		 261 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  43.28 
 
 		 309 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  43.28 
 
 		 322 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.17 
 
 		 254 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  35.54 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  37.39 
 
 		 200 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  35.96 
 
 		 194 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.92 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.44 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  37.27 
 
 		 163 aa  78.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.44 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  30.58 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0350  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.28 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  34.48 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0604  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  30.69 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  29.7 
 
 		 168 aa  67  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2415  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00722  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  33.33 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.06 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  32.74 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  30.3 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  30.09 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  30.09 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1549  hypothetical protein  30.84 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000640295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>