47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5799 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  100 
 
 		 322 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  98.55 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  59.66 
 
 		 230 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  78.87 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  71.7 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  75.18 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  69.93 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  69.18 
 
 		 261 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  69.18 
 
 		 261 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  70.42 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  45.65 
 
 		 138 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  45.24 
 
 		 138 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.84 
 
 		 139 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  40.77 
 
 		 140 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.23 
 
 		 139 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  39.39 
 
 		 148 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.17 
 
 		 139 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  46.63 
 
 		 630 aa  94.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.67 
 
 		 139 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.67 
 
 		 139 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.39 
 
 		 157 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.39 
 
 		 157 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  54.78 
 
 		 926 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  38.14 
 
 		 194 aa  86.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  35.96 
 
 		 168 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  30.97 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  36.92 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0350  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.26 
 
 		 167 aa  81.3  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  41.61 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  36.28 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  34.68 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00722  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  31.53 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25.23 
 
 		 168 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  35.78 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0604  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  25.23 
 
 		 168 aa  65.5  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2415  hypothetical protein  39.36 
 
 		 177 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  40.43 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  36.99 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4037  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.22 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158153 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  40.15 
 
 		 499 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  33.33 
 
 		 606 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0784  TfoX-like protein  46.58 
 
 		 349 aa  49.7  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0751484  normal  0.199976 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  36.61 
 
 		 407 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5377  TfoX domain-containing protein  53.66 
 
 		 223 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0365386  normal  0.0696502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2790  RNA pseudouridine synthase  42.19 
 
 		 322 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.525633  normal  0.683012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  27.27 
 
 		 522 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>