41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1550 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  254  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  57.27 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  57.8 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  45.52 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  37.23 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.67 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  32.74 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  30.91 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  32.74 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  28.43 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  30.91 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  29.47 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.8 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.8 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.73 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  33.33 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  26.04 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  30.21 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  27.66 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  27.43 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  22.62 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.1 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  28.1 
 
 		 261 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  27.68 
 
 		 257 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  26.09 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1549  hypothetical protein  31.68 
 
 		 245 aa  45.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000640295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.97 
 
 		 261 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.27 
 
 		 258 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  25.41 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  32 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1244  hypothetical protein  23.96 
 
 		 115 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0931  hypothetical protein  25.27 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  27.68 
 
 		 309 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  26.09 
 
 		 292 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1468  hypothetical protein  19.05 
 
 		 108 aa  40.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3358  hypothetical protein  30.43 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.887484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.5278 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  25 
 
 		 284 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  28.57 
 
 		 230 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  38.57 
 
 		 182 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>