30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4398 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  256  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  98.44 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0063  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  54.41 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.436738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  51.88 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1549  hypothetical protein  34.65 
 
 		 245 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000640295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  28.28 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  30.09 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  50.4  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  31.58 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  27.97 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  33.33 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  27.37 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  26.55 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0646  hypothetical protein  25.26 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000149489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  28.45 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  24.75 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.43 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  26.37 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  28.28 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1244  hypothetical protein  22.11 
 
 		 115 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  22.11 
 
 		 113 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0931  hypothetical protein  25.56 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  23.23 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  34 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  27.68 
 
 		 257 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  29.73 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  29.63 
 
 		 118 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>