20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1972 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1972  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  220  4.9999999999999996e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.538462  normal  0.163102 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  29.73 
 
 
113 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  32.63 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  31.18 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1616  hypothetical protein  32.93 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0294  hypothetical protein  31 
 
 
109 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  30.7 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1171  hypothetical protein  30.49 
 
 
108 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.666463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  31.19 
 
 
129 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  26.04 
 
 
128 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0931  hypothetical protein  30.59 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  29.41 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1336  hypothetical protein  30.36 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  28 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  27.43 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  26.8 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  26.74 
 
 
108 aa  43.9  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  26.6 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  25 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2538  hypothetical protein  25.32 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>