208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_58610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03840  conserved inner membrane protein  60.97 
 
 
577 aa  711    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4031  sulfatase  60.61 
 
 
577 aa  709    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2579  hypothetical protein  71.38 
 
 
584 aa  842    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04430  hypothetical protein  58.76 
 
 
589 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.117859  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4359  hypothetical protein  59.96 
 
 
577 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4061  hypothetical protein  60.97 
 
 
577 aa  711    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0113  hypothetical protein  57.22 
 
 
573 aa  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2584  hypothetical protein  59.27 
 
 
583 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.734058 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4494  hypothetical protein  60.79 
 
 
577 aa  709    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3283  hypothetical protein  70.38 
 
 
592 aa  841    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4328  hypothetical protein  59.96 
 
 
577 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91856  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58610  hypothetical protein  100 
 
 
600 aa  1230    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4446  hypothetical protein  59.96 
 
 
577 aa  702    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0100692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5415  hypothetical protein  60.61 
 
 
577 aa  709    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4449  hypothetical protein  59.79 
 
 
577 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.155408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3137  hypothetical protein  70.17 
 
 
584 aa  833    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4523  hypothetical protein  59.79 
 
 
577 aa  699    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03789  hypothetical protein  60.97 
 
 
577 aa  711    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4441  hypothetical protein  60.97 
 
 
577 aa  711    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5131  hypothetical protein  96.33 
 
 
600 aa  1131    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4402  hypothetical protein  60.61 
 
 
577 aa  711    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256321  normal  0.491316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4189  hypothetical protein  60.97 
 
 
577 aa  711    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0756  hypothetical protein  56.47 
 
 
565 aa  632  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.112418 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1905  hypothetical protein  31.01 
 
 
553 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1154  sulfatase  28.09 
 
 
564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.614879  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2111  phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase  24.82 
 
 
571 aa  169  1e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0774  putative membrane-associated, metal-dependent hydrolase  27.25 
 
 
560 aa  154  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000171309  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1039  integral membrane protein  28.95 
 
 
575 aa  140  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2902  sulfatase  25.17 
 
 
553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4610  sulfatase  33.44 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1711  sulfatase  28.65 
 
 
551 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.648833 
 
 
-
 
NC_004310  BR1948  hypothetical protein  26.01 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1874  hypothetical protein  26.01 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1777  sulfatase domain-containing protein  24.09 
 
 
589 aa  122  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3401  sulfatase  32.34 
 
 
614 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1865  sulfatase  27.71 
 
 
575 aa  117  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1018  sulfatase  25.62 
 
 
544 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04885  sulfatase domain protein  25.3 
 
 
552 aa  114  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568838  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3663  sulfatase  25.77 
 
 
512 aa  113  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2500  hypothetical protein  29.26 
 
 
573 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.549124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2705  sulfatase  24.8 
 
 
557 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4639  putative cell division protein  23.25 
 
 
547 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.500642  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4548  putative cell division protein  23.25 
 
 
547 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0042  hypothetical protein  26.02 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.281715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0024  hypothetical protein  26.02 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454428  hitchhiker  0.00000576677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0039  hypothetical protein  26.02 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3156  hypothetical protein  27.48 
 
 
552 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.84731  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4555  putative cell division protein  23.25 
 
 
547 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0093  sulfatase  23.7 
 
 
550 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1798  putative cell division protein  24.9 
 
 
543 aa  106  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000435221  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0039  hypothetical protein  26.02 
 
 
565 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.328486  hitchhiker  0.000197782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4639  putative cell division protein  24.12 
 
 
547 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.739605  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0802  sulfatase  25.05 
 
 
531 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4736  hypothetical protein  27.27 
 
 
515 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1318  integral membrane protein  22.67 
 
 
539 aa  101  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3047  lipid A phosphoethanolamine transferase  25.41 
 
 
506 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03039  predicted hydrolase, inner membrane  28.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02990  hypothetical protein  28.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1724  hypothetical protein  22.9 
 
 
552 aa  99.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0657943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0021  sulfatase  23.87 
 
 
524 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0526  sulfatase  28.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000512477 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2128  sulfatase  23.59 
 
 
549 aa  100  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3365  inner membrane protein yhbX  28.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00782202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3658  inner membrane protein yhbX  28.2 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0592797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4495  inner membrane protein yhbX  28.2 
 
 
505 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0722596  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0533  sulfatase  28.2 
 
 
547 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0352  membrane associated sultatease  23.82 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.310824  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3469  inner membrane protein yhbX  28.2 
 
 
505 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0525732  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2532  sulfatase  23.49 
 
 
544 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.301618  normal  0.874005 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4133  phosphoethanolamine transferase  24.01 
 
 
563 aa  98.2  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.257424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4448  lipid A phosphoethanolamine transferase  22.61 
 
 
545 aa  98.2  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.62439  hitchhiker  0.00124758 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1859  phosphoethanolamine transferase  27.8 
 
 
554 aa  97.8  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0471  phosphatidylethanolamine:Kdo2-lipid A phosphoethanolamine transferase  24.85 
 
 
555 aa  97.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.882488 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0311  putative cell division protein  23.23 
 
 
547 aa  97.4  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00469316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3323  hypothetical protein  26.09 
 
 
572 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4081  phosphoethanolamine transferase  24.05 
 
 
563 aa  97.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0080  phosphoethanolamine transferase  24.05 
 
 
563 aa  97.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3835  phosphoethanolamine transferase  27.88 
 
 
563 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00912049  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3957  phosphoethanolamine transferase  27.88 
 
 
563 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00895606  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3913  phosphoethanolamine transferase  27.88 
 
 
563 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.291921  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4017  phosphoethanolamine transferase  27.88 
 
 
563 aa  97.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.363242  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03396  predicted metal dependent hydrolase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0166  sulfatase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2985  sulfatase  25.47 
 
 
544 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00955472  normal  0.0251459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3848  phosphoethanolamine transferase  27.88 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.632743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4916  phosphoethanolamine transferase  27.55 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0170  phosphoethanolamine transferase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03347  hypothetical protein  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3747  phosphoethanolamine transferase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3983  phosphoethanolamine transferase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.449102  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4041  phosphoethanolamine transferase  27.08 
 
 
563 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1873  putative cell division protein  23.55 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000430233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3923  hypothetical protein  25.61 
 
 
547 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3867  phosphoethanolamine transferase  27.08 
 
 
563 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2563  putative cell division protein  23.55 
 
 
545 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000004423  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1978  sulfatase  22.82 
 
 
545 aa  96.3  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0677  sulfatase  24.26 
 
 
568 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0178  phosphoethanolamine transferase  27.21 
 
 
563 aa  95.5  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.11544  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1764  putative cell division protein  23.55 
 
 
545 aa  95.1  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.95541e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0236  sulfatase  24.07 
 
 
535 aa  94.7  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>