More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_14651 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  100 
 
 
338 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  57.83 
 
 
349 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  55.96 
 
 
379 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  55.68 
 
 
372 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  60.06 
 
 
366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  60.47 
 
 
342 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  60.36 
 
 
344 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  53.98 
 
 
380 aa  379  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  56.98 
 
 
357 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  53.69 
 
 
362 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  50.84 
 
 
384 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  53.78 
 
 
362 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  52.03 
 
 
373 aa  335  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  51.44 
 
 
378 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  51.44 
 
 
378 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  44.78 
 
 
346 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  44.78 
 
 
346 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  42.46 
 
 
327 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  42.69 
 
 
349 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  43.88 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  43.94 
 
 
341 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  61.62 
 
 
362 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  62.63 
 
 
383 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  62 
 
 
379 aa  255  7e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  37.27 
 
 
320 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 
332 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
335 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.64 
 
 
349 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.31 
 
 
320 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.68 
 
 
345 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.54 
 
 
324 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  36.28 
 
 
362 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.78 
 
 
320 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.86 
 
 
343 aa  202  9e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.23 
 
 
350 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.28 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.92 
 
 
347 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.45 
 
 
355 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.16 
 
 
353 aa  200  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.86 
 
 
353 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  36.46 
 
 
354 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  34.75 
 
 
361 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.44 
 
 
326 aa  192  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 
336 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 
328 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 
358 aa  192  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.94 
 
 
328 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 
323 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 
360 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 
323 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 
323 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  45.13 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  36.06 
 
 
364 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.76 
 
 
323 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.86 
 
 
367 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  35.16 
 
 
369 aa  189  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.7 
 
 
355 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  34.64 
 
 
323 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  46.57 
 
 
369 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.76 
 
 
360 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  35.35 
 
 
324 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.41 
 
 
400 aa  185  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.55 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.2 
 
 
457 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.72 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  48.13 
 
 
363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  43.04 
 
 
365 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  40 
 
 
452 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  30.41 
 
 
395 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.23 
 
 
460 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 
364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.33 
 
 
406 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  42.79 
 
 
449 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.29 
 
 
449 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  30.41 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 
364 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.29 
 
 
449 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  41.87 
 
 
460 aa  178  9e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  33.78 
 
 
400 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  30.41 
 
 
395 aa  178  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  30 
 
 
527 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 
319 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.43 
 
 
316 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 
408 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  29.64 
 
 
395 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
323 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  30.15 
 
 
395 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  29.9 
 
 
395 aa  176  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 
424 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.63 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  42.35 
 
 
493 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.87 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3246  cobalamin synthesis protein/P47K  32.4 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  29.38 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.87 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0065  cobalamin synthesis protein P47K  31.89 
 
 
433 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  29.64 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>