71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_11631 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_11631  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0312993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0717  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbH  79.49 
 
 
351 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15541  hypothetical protein  79.49 
 
 
351 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11571  hypothetical protein  68.8 
 
 
361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0991489 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15611  hypothetical protein  71.35 
 
 
354 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.732375  normal  0.917864 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0723  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  71.35 
 
 
354 aa  512  1e-144  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.543048  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15561  hypothetical protein  70.38 
 
 
349 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.95378 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0719  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbB  70.38 
 
 
349 aa  500  1e-140  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.17492  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11601  hypothetical protein  69.48 
 
 
349 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0985613 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15551  hypothetical protein  63.03 
 
 
370 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.203138  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0718  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbC  62.75 
 
 
370 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0722  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbE  65.17 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.683508  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15601  hypothetical protein  65.17 
 
 
362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.963648 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06881  light-harvesting complex protein  64.87 
 
 
349 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0066  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbA  64.59 
 
 
349 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14281  hypothetical protein  63.56 
 
 
365 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517015 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0627  light-harvesting complex protein  65.82 
 
 
352 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.536853  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07351  light-harvesting complex protein  65.71 
 
 
351 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.112937 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06931  light-harvesting complex protein  63.84 
 
 
352 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06831  light-harvesting complex protein  64.12 
 
 
352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06541  light-harvesting complex protein  64.12 
 
 
352 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14531  hypothetical protein  58.97 
 
 
355 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358475 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08471  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  59.94 
 
 
352 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.679252  hitchhiker  0.00174435 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0215  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  59.83 
 
 
352 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09521  hypothetical protein  58.4 
 
 
352 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000722234 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1271  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.5 
 
 
352 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0702178  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13631  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.5 
 
 
352 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13721  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  56.78 
 
 
352 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13421  hypothetical protein  55.93 
 
 
352 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.233914  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10131  light-harvesting complex protein  56.09 
 
 
350 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17721  light-harvesting complex protein  54.87 
 
 
368 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1005  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  50.71 
 
 
359 aa  336  2.9999999999999997e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1590  chlorophyll a/b binding light harvesting protein PcbD  48.73 
 
 
345 aa  324  1e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10047  hitchhiker  0.00277314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2434  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  43.1 
 
 
342 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000346716  hitchhiker  0.0000000117955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1795  chlorophyll a/b binding light-harvesting protein  41.74 
 
 
359 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1542  iron-stress chlorophyll-binding protein  42.9 
 
 
342 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398653  normal  0.0103257 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1667  photosystem antenna protein-like  39.49 
 
 
344 aa  242  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00889751  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2484  photosystem antenna protein-like  35.45 
 
 
343 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.965644  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2485  photosystem antenna protein-like  34.26 
 
 
522 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.90279  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2483  photosystem antenna protein-like  33.94 
 
 
368 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08421  photosystem II PsbC protein (CP43)  35.44 
 
 
464 aa  137  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13251  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.86 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  unclonable  0.000121028  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13501  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.86 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.151398  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13351  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.86 
 
 
460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0656  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  34.17 
 
 
461 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1257  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.5 
 
 
460 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0172037  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0768  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.74 
 
 
460 aa  131  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16081  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.74 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.548682  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12341  photosystem II PsbC protein (CP43)  32.38 
 
 
460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.606702  normal  0.098859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0578  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.73 
 
 
459 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1060  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.73 
 
 
461 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0000366993  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0513  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.29 
 
 
459 aa  126  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0053  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.99 
 
 
460 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000498494  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0055  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  31.99 
 
 
460 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1243  photosynthetic II protein PsbC  32.37 
 
 
459 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.2113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0217  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  32.03 
 
 
473 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0294116  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1993  photosystem II 44 kDa subunit reaction center protein  29.69 
 
 
462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.296438  normal  0.146878 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0667  photosynthetic II protein PsbC  29.76 
 
 
462 aa  112  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.329399  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03471  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.61 
 
 
507 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0321  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.95 
 
 
507 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03401  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.95 
 
 
507 aa  57.4  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03391  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.95 
 
 
507 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0452672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04051  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.18 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.644071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1692  photosystem II PsbB protein (CP47)  29.18 
 
 
507 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03501  photosystem II PsbB protein (CP47)  26.84 
 
 
518 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.234957  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0697  photosystem II core light harvesting protein  29.6 
 
 
508 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00000016119  normal  0.0946335 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22121  photosystem II PsbB protein (CP47)  28.57 
 
 
510 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0470  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  27.56 
 
 
519 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1864  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  28.21 
 
 
519 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0861  photosystem II chlorophyll-binding protein CP47  29.6 
 
 
510 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000036456  decreased coverage  0.00000114007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4666  photosystem antenna protein-like  28.93 
 
 
508 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0622483  normal  0.0120025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>