More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4169 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  74.08 
 
 
478 aa  748    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  100 
 
 
486 aa  1011    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  57.67 
 
 
470 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  57.66 
 
 
482 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  55.44 
 
 
466 aa  548  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  57.43 
 
 
470 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  56.7 
 
 
469 aa  542  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  55.13 
 
 
477 aa  540  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  55.58 
 
 
470 aa  538  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  53.83 
 
 
471 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  54.78 
 
 
485 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  54.04 
 
 
471 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  54.55 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  56.53 
 
 
481 aa  540  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  55.51 
 
 
481 aa  535  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  53.35 
 
 
473 aa  537  1e-151  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  54.53 
 
 
471 aa  536  1e-151  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  56.31 
 
 
470 aa  535  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  55.36 
 
 
470 aa  535  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  54.95 
 
 
479 aa  532  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  51.98 
 
 
480 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  51.64 
 
 
487 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  54.41 
 
 
481 aa  534  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  51.64 
 
 
487 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  51.63 
 
 
485 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  54.35 
 
 
479 aa  533  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  51.64 
 
 
487 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  55.63 
 
 
479 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.14 
 
 
483 aa  528  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  56.4 
 
 
465 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  53.42 
 
 
487 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  55.18 
 
 
470 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  54.73 
 
 
479 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  56.4 
 
 
465 aa  528  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  53.7 
 
 
487 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  54.95 
 
 
470 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  53.7 
 
 
470 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  52.09 
 
 
485 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  54.83 
 
 
465 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  54.83 
 
 
465 aa  521  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  54.83 
 
 
465 aa  521  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  54.83 
 
 
465 aa  521  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  53.9 
 
 
466 aa  521  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  55.33 
 
 
470 aa  523  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  54.05 
 
 
476 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  54.61 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  54.61 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  54.88 
 
 
470 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  53.38 
 
 
476 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  54.61 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  54.65 
 
 
490 aa  518  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  54.61 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  54.61 
 
 
465 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  53.38 
 
 
472 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  54.32 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  53.64 
 
 
472 aa  518  1.0000000000000001e-145  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  54.85 
 
 
463 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  54.38 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  54.2 
 
 
482 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  55.23 
 
 
465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  55.78 
 
 
468 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  53.91 
 
 
467 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  55.1 
 
 
478 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  53.18 
 
 
465 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  53.18 
 
 
465 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  53.59 
 
 
469 aa  504  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  53.74 
 
 
477 aa  506  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  50.21 
 
 
472 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  52.9 
 
 
475 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  48.84 
 
 
469 aa  493  9.999999999999999e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  52.03 
 
 
499 aa  491  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  52.25 
 
 
552 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  50.33 
 
 
470 aa  464  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  45.06 
 
 
464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  46.42 
 
 
467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  44.85 
 
 
464 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  47.19 
 
 
462 aa  440  9.999999999999999e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  47.17 
 
 
470 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  46.12 
 
 
475 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  47.38 
 
 
476 aa  437  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  47.38 
 
 
476 aa  433  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  46.72 
 
 
476 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  43.32 
 
 
488 aa  427  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  45.75 
 
 
475 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  47.01 
 
 
476 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  43.39 
 
 
463 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5848  FeS assembly protein SufB  47.15 
 
 
489 aa  423  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  45.45 
 
 
471 aa  425  1e-117  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  45.78 
 
 
469 aa  423  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0903  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  47.78 
 
 
479 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.698601  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5109  FeS assembly protein SufB  47.15 
 
 
489 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0889  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  46.89 
 
 
479 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.741198  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0084  FeS assembly protein SufB  46.34 
 
 
494 aa  418  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.597876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4457  FeS assembly protein SufB  46.93 
 
 
489 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985425  normal  0.145425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0694  FeS assembly protein SufB  46.71 
 
 
489 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.415749  normal  0.0650499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0843  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  46.67 
 
 
479 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  44.79 
 
 
476 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2272  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  44.72 
 
 
483 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3284  FeS assembly protein SufB  46.14 
 
 
479 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2255  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  43.35 
 
 
507 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>