31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0610 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0610  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  268  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0613  hypothetical protein  84.67 
 
 		 137 aa  211  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.764284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0615  hypothetical protein  79.41 
 
 		 137 aa  198  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0340  hypothetical protein  30.08 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466882  normal  0.179324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1996  hypothetical protein  31.65 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000045203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1998  hypothetical protein  27.34 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.001435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0342  hypothetical protein  29.17 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000322969  normal  0.532005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0132  hypothetical protein  26.92 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3219  hypothetical protein  28.24 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3514  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.888189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2371  hypothetical protein  26.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000054432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2474  hypothetical protein  26.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000241237  normal  0.0265077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2358  hypothetical protein  26.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000446127  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1988  hypothetical protein  26.4 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000081199  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4139  hypothetical protein  29.11 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.384863 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00917227  normal  0.51587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3456  hypothetical protein  32.5 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3076  hypothetical protein  30.61 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.127053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1301  hypothetical protein  30.61 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0515359  normal  0.898737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0621  hypothetical protein  26.26 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.2697 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0730491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3977  hypothetical protein  30.77 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2033  hypothetical protein  22.83 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4505  hypothetical protein  27.27 
 
 		 136 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.646006  normal  0.20017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01733  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  28.72 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00119694  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0606  hypothetical protein  27.55 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2997  hypothetical protein  29.75 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.469628  normal  0.623946 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01220  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2532  hypothetical protein  25.29 
 
 		 143 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1422  hypothetical protein  26.67 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1107  hypothetical protein  25 
 
 		 135 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.977512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>