More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2087 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03755  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4116  glutamine synthetase, type I  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1344  glutamine synthetase, type I  63.75 
 
 
469 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1216  glutamine synthetase, type I  77.78 
 
 
469 aa  765    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2654  glutamine synthetase, type I  77.4 
 
 
469 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0733  glutamine synthetase, type I  81.24 
 
 
469 aa  825    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.02678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2853  glutamine synthetase, type I  70.02 
 
 
469 aa  692    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.725754  normal  0.0528794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2333  glutamine synthetase, type I  76.76 
 
 
469 aa  776    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.869582  normal  0.133369 
 
 
-
 
NC_004310  BR1004  glutamine synthetase, type I  94.03 
 
 
469 aa  931    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4146  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1632  glutamine synthetase, type I  65.6 
 
 
471 aa  644    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1442  L-glutamine synthetase  63.25 
 
 
471 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2377  glutamine synthetase, type I  77.4 
 
 
469 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.476577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4346  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2318  glutamine synthetase  64.74 
 
 
469 aa  641    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3585  glutamine synthetase, type I  74.41 
 
 
471 aa  755    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110089  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6588  glutamine synthetase, type I  76.87 
 
 
470 aa  777    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4392  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.519647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1904  glutamine synthetase type I  79.1 
 
 
469 aa  799    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.394003 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4218  glutamine synthetase  65.6 
 
 
469 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.670348  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2652  glutamine synthetase type I  64.81 
 
 
469 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127344  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3959  glutamine synthetase  65.3 
 
 
469 aa  645    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0147  L-glutamine synthetase  63.97 
 
 
469 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0281822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4581  L-glutamine synthetase  76.92 
 
 
469 aa  784    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163262  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5316  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.961991  normal  0.126376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1736  glutamine synthetase, type I  88.68 
 
 
469 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.654979  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4831  L-glutamine synthetase  69.61 
 
 
470 aa  692    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1839  glutamine synthetase  66.52 
 
 
468 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.724651  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03704  hypothetical protein  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3244  glutamine synthetase, type I  74.73 
 
 
468 aa  754    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3315  glutamine synthetase, type I  79.27 
 
 
469 aa  800    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.651786  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2086  L-glutamine synthetase  67.38 
 
 
469 aa  671    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4289  glutamine synthetase  65.6 
 
 
469 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.438385  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0970  glutamine synthetase, type I  93.6 
 
 
469 aa  930    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.545228  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4335  glutamine synthetase  65.6 
 
 
469 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5127  glutamine synthetase, type I  76.33 
 
 
469 aa  780    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.032898  normal  0.611689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4156  glutamine synthetase  65.09 
 
 
469 aa  644    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35339  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3057  glutamine synthetase, type I  66.24 
 
 
477 aa  672    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4097  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2558  glutamine synthetase, type I  78.21 
 
 
469 aa  793    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728767  normal  0.913477 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1108  L-glutamine synthetase  69.08 
 
 
469 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0181625  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1389  glutamine synthetase, type I  89.13 
 
 
469 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.737079  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5853  glutamine synthetase  65.94 
 
 
469 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1515  L-glutamine synthetase  64.03 
 
 
468 aa  646    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.274657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0502  L-glutamine synthetase  65.66 
 
 
468 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000320948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2386  glutamine synthetase, type I  78.42 
 
 
469 aa  789    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35436  normal  0.41443 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001905  glutamine synthetase type I  64.1 
 
 
469 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.168817  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4239  glutamine synthetase  65.6 
 
 
469 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2901  glutamine synthetase, type I  79.06 
 
 
469 aa  797    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0513537  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2234  glutamine synthetase, type I  78.42 
 
 
469 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356963  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4396  glutamine synthetase  65.6 
 
 
469 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1022  L-glutamine synthetase  66.09 
 
 
468 aa  664    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562141  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0149  glutamine synthetase, type I  69.44 
 
 
470 aa  699    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1780  glutamine synthetase, type I  63.97 
 
 
469 aa  647    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1544  L-glutamine synthetase  88.7 
 
 
469 aa  892    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4255  glutamine synthetase  65.81 
 
 
469 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.743533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2087  glutamine synthetase, type I  100 
 
 
469 aa  976    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0427  glutamine synthetase, type I  76.71 
 
 
469 aa  757    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1482  glutamine synthetase, type I  68.47 
 
 
486 aa  692    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.140298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1330  L-glutamine synthetase  71.67 
 
 
467 aa  712    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.523028  normal  0.654119 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67600  glutamine synthetase  65.94 
 
 
469 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2375  glutamine synthetase  88.49 
 
 
469 aa  884    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.290662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4096  glutamine synthetase  64.96 
 
 
469 aa  647    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1920  glutamine synthetase, type I  88.46 
 
 
469 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4462  glutamine synthetase, type I  65.95 
 
 
468 aa  659    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0756731  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7410  glutamine synthetase, type I  75.59 
 
 
470 aa  767    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0406511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4220  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45850  glutamine synthetase, type I; GlnA  64.79 
 
 
467 aa  633  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00588  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0030  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0027  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1807  L-glutamine synthetase  63.03 
 
 
471 aa  633  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000345989 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01591  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1025  glutamine synthetase  65.01 
 
 
469 aa  633  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0013  L-glutamine synthetase  63.68 
 
 
471 aa  632  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.778405 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4189  glutamine synthetase  63.25 
 
 
469 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3416  glutamine synthetase  65.17 
 
 
469 aa  632  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0626  glutamine synthetase, type I  62.88 
 
 
471 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2076  L-glutamine synthetase  63.03 
 
 
472 aa  629  1e-179  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943231  normal  0.983586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4503  glutamine synthetase  63.03 
 
 
469 aa  628  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.664136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1217  glutamine synthetase, type I  63.68 
 
 
471 aa  630  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0243  L-glutamine synthetase  64.01 
 
 
469 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1109  glutamine synthetase, type I  62.39 
 
 
471 aa  628  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2940  glutamine synthetase  63.03 
 
 
469 aa  629  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0466  glutamine synthetase, type I  62.88 
 
 
471 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3554  glutamine synthetase  64.74 
 
 
469 aa  629  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0988  L-glutamine synthetase  63.3 
 
 
473 aa  628  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1179  glutamine synthetase, type I  62.8 
 
 
471 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1258  glutamine synthetase protein  63.23 
 
 
471 aa  626  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.859472 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1189  L-glutamine synthetase  62.18 
 
 
471 aa  626  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.868262  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4881  glutamine synthetase  62.39 
 
 
469 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567284  hitchhiker  0.000124189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5002  glutamine synthetase, type I  61.75 
 
 
471 aa  625  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1086  glutamine synthetase, type I  62.8 
 
 
471 aa  625  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2979  glutamine synthetase, type I  63.03 
 
 
471 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0305  glutamine synthetase  64.53 
 
 
469 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3719  glutamine synthetase  64.53 
 
 
469 aa  625  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.606524  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3154  glutamine synthetase, type I  62.39 
 
 
471 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1122  glutamine synthetase, type I  61.32 
 
 
471 aa  625  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.744153  normal  0.286491 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0300  glutamine synthetase  64.32 
 
 
469 aa  624  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.114886  hitchhiker  0.00271616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0412  glutamine synthetase  64.32 
 
 
469 aa  625  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>