13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_15312 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  100 
 
 
1359 aa  2754    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27805  predicted protein  20.96 
 
 
3100 aa  82.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.836197 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  23.77 
 
 
3060 aa  74.3  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  20.31 
 
 
2415 aa  65.9  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  29.1 
 
 
852 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18205  predicted protein  22.75 
 
 
3454 aa  56.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27.5 
 
 
1755 aa  53.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  24.93 
 
 
575 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  24.36 
 
 
575 aa  49.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2156  polymorphic outer membrane protein  30.7 
 
 
526 aa  48.9  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927153  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  28.65 
 
 
541 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  35.09 
 
 
1750 aa  46.2  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  32.89 
 
 
501 aa  45.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>