32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3132 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  278  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13164  response regulator  71.43 
 
 		 133 aa  193  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4480  response regulator receiver protein  72.87 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00179886 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1581  response regulator receiver protein  73.77 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.996802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1605  response regulator receiver protein  73.77 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1551  response regulator receiver protein  73.77 
 
 		 134 aa  187  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0910049  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1886  response regulator receiver protein  67.94 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.734849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1674  response regulator receiver protein  59.09 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3064  response regulator receiver protein  58.87 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0048778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0402  hypothetical protein  57.78 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1023  putative response regulator  52.94 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.130012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3136  response regulator receiver protein  55.3 
 
 		 146 aa  158  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2678  response regulator receiver protein  58.4 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.858838 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1297  response regulator receiver protein  61.54 
 
 		 131 aa  157  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0965  response regulator receiver protein  58.91 
 
 		 135 aa  157  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.206702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3167  response regulator receiver protein  57.66 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1371  response regulator receiver protein  53.49 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10660  hypothetical protein  53.49 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15720  hypothetical protein  51.82 
 
 		 146 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.415712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1805  response regulator receiver protein  51.64 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1893  response regulator receiver protein  52.46 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127088  hitchhiker  0.00000556231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3113  response regulator receiver protein  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.630286  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1445  response regulator receiver protein  51.88 
 
 		 139 aa  126  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0798092  normal  0.329727 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2074  response regulator receiver protein  52.63 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2007  response regulator receiver protein  49.17 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.270937  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4121  response regulator receiver protein  43.51 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3297  hypothetical protein  45.97 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257585  normal  0.158078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3529  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000118426 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3247  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187591  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3339  putative two-component system response regulator  45.9 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2266  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  31.78 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.65 
 
 		 227 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>