More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1754 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1754  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
394 aa  773  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09950  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  52.66 
 
 
375 aa  332  1e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0644  glycosyl transferase family protein  52.33 
 
 
369 aa  329  5e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.666126  normal  0.192967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0327  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  50.86 
 
 
387 aa  328  1e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.188042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3716  glycosyl transferase family protein  55.07 
 
 
369 aa  326  4e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1014  glycosyl transferase family protein  54.68 
 
 
369 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.258485  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1209  glycosyl transferase family 4  49.71 
 
 
449 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1261  glycosyl transferase family 4  48.97 
 
 
394 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.644979  normal  0.0359873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4145  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  54.23 
 
 
416 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1662  glycosyltransferase  48.77 
 
 
425 aa  310  3e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1782  glycosyl transferase family 4  47.11 
 
 
382 aa  306  3e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.219636  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6145  glycosyl transferase family 4  46.86 
 
 
389 aa  306  4e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1083  glycosyltransferase, group 4 family  43.28 
 
 
367 aa  302  7e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1898  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  42.2 
 
 
427 aa  302  8e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.18974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11329  undecapaprenyl-phosphate alpha-N-acetylglucosaminyltransferase rfe  47.62 
 
 
404 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2416  putative teichoic acid linkage unit synthesis (synthesis of undecaprenylpyrophosphate-N-aetylglucosamine )  47.4 
 
 
387 aa  290  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.484516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1064  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  52.03 
 
 
370 aa  289  6e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0891  family 4 glycosyl transferase  47.01 
 
 
402 aa  287  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3870  glycosyl transferase family protein  50.44 
 
 
399 aa  286  3e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0269562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3958  glycosyl transferase family protein  50.44 
 
 
399 aa  286  3e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.2919 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3884  glycosyl transferase family protein  50.44 
 
 
399 aa  286  3e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.079088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1913  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  50.89 
 
 
403 aa  283  3e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.470989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4336  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 
405 aa  283  3e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.713861  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2116  glycosyl transferase family 4  44.62 
 
 
391 aa  283  4e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.239722  normal  0.0546819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3925  glycosyl transferase family 4  53.75 
 
 
383 aa  282  6e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2456  glycosyl transferase family 4  45.48 
 
 
399 aa  281  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29630  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  48.29 
 
 
396 aa  273  4e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1290  glycosyl transferase family 4  49.85 
 
 
372 aa  269  5e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2310  glycosyl transferase family protein  50.59 
 
 
405 aa  260  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.440148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18290  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  49.7 
 
 
368 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1247  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  45.82 
 
 
405 aa  239  8e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.910947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2347  glycosyl transferase family 4  41.32 
 
 
370 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000273698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19210  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  49.85 
 
 
377 aa  229  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2614  glycosyl transferase family protein  40.63 
 
 
386 aa  215  1e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.143925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1804  glycosyl transferase family 4  40.27 
 
 
367 aa  199  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08100  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  43.48 
 
 
379 aa  195  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3322  glycosyl transferase family protein  33.79 
 
 
355 aa  164  4e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0124  glycosyl transferase family protein  36.59 
 
 
371 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  7.90838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3047  glycosyl transferase family 4  34.77 
 
 
354 aa  156  5e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4628  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.54 
 
 
407 aa  154  3e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.520288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17910  glycosyl transferase family 4  34.45 
 
 
351 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2376  glycosyl transferase family 4  34.59 
 
 
312 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0310608  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0218  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
349 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2600  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
376 aa  148  1e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4113  glycosyl transferase family 4  33.33 
 
 
366 aa  147  2e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  3.68413e-06  hitchhiker  4.636e-06 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3102  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
361 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.98419e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1971  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.42 
 
 
354 aa  148  2e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2092  glycosyl transferase family protein  36.96 
 
 
353 aa  148  2e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0525  Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase  32.09 
 
 
406 aa  147  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  3.46321e-05  unclonable  4.70096e-08 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0281  glycosyltransferase  35.8 
 
 
357 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3260  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  33.24 
 
 
360 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3746  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
357 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00672292  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3206  family 4 glycosyl transferase  35.31 
 
 
360 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.514524  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2406  glycosyl transferase family 4  33.07 
 
 
348 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  9.55005e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4878  glycosyl transferase family protein  32.66 
 
 
369 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.777733  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0262  UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase  33.13 
 
 
762 aa  141  2e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0133132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0217  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  31.85 
 
 
385 aa  141  2e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0140  glycosyl transferase, group 4 family protein  32.39 
 
 
386 aa  141  2e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2516  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  35.85 
 
 
370 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3395  glycosyl transferase family 4  36.06 
 
 
340 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324649  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0835  glycosyl transferase family 4  29.91 
 
 
326 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4880  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
357 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0771  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
351 aa  140  4e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00610763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0788  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
351 aa  140  4e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000170837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5050  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.2 
 
 
357 aa  140  5e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5435  group 4 family glycosyl transferase  31.2 
 
 
357 aa  140  5e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5291  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.2 
 
 
357 aa  140  5e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.05483e-08 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14670  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  34.38 
 
 
391 aa  139  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0872844  decreased coverage  3.74023e-07 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4524  glycosyl transferase family protein  35.98 
 
 
336 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183684  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0017  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 
333 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000233702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4895  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.9 
 
 
357 aa  139  9e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3765  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
360 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00610476  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1336  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  30.17 
 
 
380 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  8.28029e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5367  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.61 
 
 
357 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.333847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4995  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 
357 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5311  glycosyl transferase, group 4 family protein  31.12 
 
 
353 aa  137  3e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1975  UDP-N-acetylmuramyl pentapeptide phosphotransferase/UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.92 
 
 
441 aa  137  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0917  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  31.64 
 
 
321 aa  135  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5322  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.28 
 
 
357 aa  135  1e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3327  glycosyl transferase family protein  37.06 
 
 
521 aa  135  1e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.198466 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1319  putative UDP-N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase  28.99 
 
 
329 aa  135  1e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0207184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5637  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.28 
 
 
357 aa  135  1e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3302e-10 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2593  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  30.7 
 
 
405 aa  134  2e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.268685 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1111  glycosyl transferase family 4  30.63 
 
 
340 aa  132  8e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0814106  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0401  Glycosyl transferase, family 4, conserved region  36.36 
 
 
491 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.140258  normal  0.190624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4277  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
495 aa  132  1e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0390  glycosyl transferase family 4  29.47 
 
 
384 aa  131  2e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0358308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2077  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
348 aa  131  2e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.212955  hitchhiker  0.00061556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4433  glycosyl transferase family protein  35.53 
 
 
496 aa  130  4e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1677  glycosyl transferase family 4  33.14 
 
 
349 aa  130  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2170  glycosyl transferase family 4  33.72 
 
 
375 aa  128  2e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0414  glycosyl transferase, group 4 family protein  29.22 
 
 
359 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4071  glycosyl transferase family protein  32.48 
 
 
375 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.507876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1905  glycosyl transferase family 4  34.13 
 
 
399 aa  123  5e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2888  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
380 aa  123  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  1.9692e-06  normal  0.0658114 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1605  putative teichoic acid linkage unit synthesis protein  30.54 
 
 
319 aa  123  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000246024  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1974  glycosyl transferase family 4  31.1 
 
 
393 aa  122  1e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1886  glycosyl transferase, group 4 family protein  30.54 
 
 
319 aa  121  2e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2584  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
542 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2661  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 
372 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.705684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>