96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0783 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0783  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 
388 aa  774    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3639  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  62.83 
 
 
389 aa  474  1e-133  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000739402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3396  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  62.34 
 
 
389 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.705544  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1653  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  60.51 
 
 
398 aa  425  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0173557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12850  hypothetical protein  61.32 
 
 
391 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4764  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  57.77 
 
 
410 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3887  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  59.07 
 
 
386 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.011216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3008  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  56.08 
 
 
402 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.762164  normal  0.0490762 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0020  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  48.84 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.947878 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2123  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  40.33 
 
 
419 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0383643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2300  Saccharopine dehydrogenase  43.83 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0134168  hitchhiker  0.00267876 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  42.21 
 
 
430 aa  232  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0538  saccharopine dehydrogenase  42.79 
 
 
394 aa  232  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1467  saccharopine dehydrogenase  39.51 
 
 
413 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.071229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2039  Saccharopine dehydrogenase  45.74 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.823725  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2140  saccharopine dehydrogenase  39.95 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.307672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3564  saccharopine dehydrogenase  41.63 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389675  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0138  saccharopine dehydrogenase  33.81 
 
 
432 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4609  hypothetical protein  37.91 
 
 
392 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.856643  normal  0.0914614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0966  saccharopine dehydrogenase  37.31 
 
 
394 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.287353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3229  Saccharopine dehydrogenase  37.96 
 
 
405 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0356215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3626  saccharopine dehydrogenase  39.47 
 
 
410 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3559  saccharopine dehydrogenase  41.59 
 
 
419 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.924034  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3632  saccharopine dehydrogenase  41.59 
 
 
419 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.288883 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0129  hypothetical protein  34.05 
 
 
432 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.150233  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2628  saccharopine dehydrogenase  40.38 
 
 
420 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1758  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.23 
 
 
407 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.819467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1410  saccharopine dehydrogenase  39.45 
 
 
393 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0726  Saccharopine dehydrogenase  40.28 
 
 
421 aa  205  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.945634  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2468  saccharopine dehydrogenase  38.79 
 
 
392 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01040  Saccharopine dehydrogenase  37.38 
 
 
391 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3953  saccharopine dehydrogenase  41.63 
 
 
421 aa  202  6e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0682928  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2098  Saccharopine dehydrogenase  42.23 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.176484  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12475  hypothetical protein  41.05 
 
 
419 aa  199  5e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.487465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5529  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  38.04 
 
 
413 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0528  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  36.99 
 
 
414 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4278  saccharopine dehydrogenase  37.66 
 
 
388 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7476  putative saccharopine dehydrogenase  38.15 
 
 
414 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5854  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.47 
 
 
419 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6045  saccharopine dehydrogenase  37.53 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.233405 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6531  saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.41 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  0.0830191 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5681  saccharopine dehydrogenase  37.53 
 
 
416 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0612  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate- forming)  39.76 
 
 
404 aa  184  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4088  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  37.9 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0541  Saccharopine dehydrogenase (NAD(+), L-glutamate-forming)  35.41 
 
 
414 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0761  saccharopine dehydrogenase  36.48 
 
 
390 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.092015  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0147  saccharopine dehydrogenase  37.22 
 
 
390 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1105  Saccharopine dehydrogenase  38.57 
 
 
422 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6092  saccharopine dehydrogenase  36.45 
 
 
419 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.207649  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12967  hypothetical protein  38.46 
 
 
418 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2873  saccharopine dehydrogenase  38.18 
 
 
404 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0514  saccharopine dehydrogenase  32.49 
 
 
377 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895808  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32292  predicted protein  32.29 
 
 
502 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355171  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07293  conserved hypothetical protein  29.04 
 
 
430 aa  140  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.087222 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03750  conserved hypothetical protein  30.19 
 
 
427 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_41409  predicted protein  26.59 
 
 
1506 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.974379  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1643  saccharopine dehydrogenase  38.26 
 
 
382 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89710  predicted protein  31.89 
 
 
436 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.332936 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4124  Saccharopine dehydrogenase  33.43 
 
 
361 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3455  saccharopine dehydrogenase  40.74 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.750747  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16272  predicted protein  34.55 
 
 
498 aa  89.4  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15850  UbiD family decarboxylase  39.01 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.647693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5762  Saccharopine dehydrogenase  30.13 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.353531 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2359  Saccharopine dehydrogenase  29.84 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0263338  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  25.64 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1135  Saccharopine dehydrogenase  35.16 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4206  saccharopine dehydrogenase  33.59 
 
 
371 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56730  hypothetical protein  28.16 
 
 
352 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2027  saccharopine dehydrogenase  31.72 
 
 
351 aa  63.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0488088  normal  0.664425 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3635  Saccharopine dehydrogenase  29.41 
 
 
363 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3058  saccharopine dehydrogenase  34.86 
 
 
348 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2986  saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 
365 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0188424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001157  putative integral membrane protein  27.46 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4933  hypothetical protein  27.35 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.76632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3544  putative integral membrane protein  28.89 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0176  hypothetical protein  31.34 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3185  Saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.418477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3084  Saccharopine dehydrogenase  31.52 
 
 
352 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1054  hypothetical protein  23.18 
 
 
351 aa  56.2  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.380877  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1149  hypothetical protein  23.18 
 
 
351 aa  55.8  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1339  Saccharopine dehydrogenase  35.21 
 
 
343 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.072139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6607  saccharopine dehydrogenase  30.9 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3672  saccharopine dehydrogenase  28.16 
 
 
353 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.420648 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  28.65 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4494  saccharopine dehydrogenase  29.66 
 
 
343 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.802239  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6392  saccharopine dehydrogenase:NmrA-like  29.06 
 
 
377 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.370059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0316  saccharopine dehydrogenase  32.67 
 
 
395 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.424303  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2316  Saccharopine dehydrogenase  27.5 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5825  saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5035  saccharopine dehydrogenase  28.21 
 
 
376 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5296  saccharopine dehydrogenase  29.37 
 
 
351 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.813788  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  29.93 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2746  saccharopine dehydrogenase  28.07 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000611807  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4354  saccharopine dehydrogenase  27.35 
 
 
376 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0494  saccharopine dehydrogenase  29.2 
 
 
371 aa  43.1  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.961307  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  26.55 
 
 
454 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>