19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1377 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1377  membrane protein-like  100 
 
 
56 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2887  hypothetical protein  78.38 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.709191  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1389  hypothetical protein  78.38 
 
 
175 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00355367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5123  membrane protein of uknown function UCP014873  75 
 
 
206 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.305727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1351  membrane protein of uknown function UCP014873  75 
 
 
202 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1191  hypothetical protein  75 
 
 
232 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0472376 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0848  hypothetical protein  70.27 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0077  hypothetical protein  73.53 
 
 
179 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0656  hypothetical protein  59.46 
 
 
182 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.862782  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2446  hypothetical protein  70.97 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000526152  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1649  membrane protein of uknown function UCP014873  48.65 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.983052  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1622  membrane protein of uknown function UCP014873  48.65 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0592  hypothetical protein  51.06 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2287  hypothetical protein  52.78 
 
 
193 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6898  hypothetical protein  56.76 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5486  membrane protein of uknown function UCP014873  56.76 
 
 
176 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648729  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2201  hypothetical protein  52.94 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0096  hypothetical protein  47.06 
 
 
173 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1506  membrane protein of uknown function UCP014873  50 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>