50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0226 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  4e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  52.67 
 
 
196 aa  147  7e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  50.34 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  53.73 
 
 
198 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  47.4 
 
 
164 aa  130  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  51.59 
 
 
160 aa  130  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.29 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  49.29 
 
 
164 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  49.29 
 
 
164 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  53.73 
 
 
180 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  53.33 
 
 
167 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  47.95 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  48.2 
 
 
183 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  45.95 
 
 
167 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  46.31 
 
 
167 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  47.89 
 
 
166 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.86 
 
 
164 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  44.78 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.86 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  47.55 
 
 
166 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  42.47 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  43.33 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  51.96 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  48.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  41.1 
 
 
160 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  46.92 
 
 
157 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  46.83 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  47.01 
 
 
162 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  35.29 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  31.82 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  27.78 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  31.71 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  27.72 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  28.15 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  27.56 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  27.34 
 
 
193 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01174  lipoprotein, putative  32.17 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.76 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  25.18 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  25 
 
 
165 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50940  hypothetical protein  23.97 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30636  hitchhiker  0.0000172849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4345  hypothetical protein  24.31 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  26.57 
 
 
167 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  26.57 
 
 
167 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19360  hypothetical protein  24.79 
 
 
136 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.865107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>