More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0090 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3235  DNA translocase FtsK  57.13 
 
 
840 aa  853  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4194  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.48 
 
 
951 aa  749  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445928  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3052  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.07 
 
 
890 aa  756  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3705  DNA translocase FtsK  69.76 
 
 
849 aa  701  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0960  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.21 
 
 
858 aa  868  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74 
 
 
830 aa  761  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1300  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.78 
 
 
853 aa  764  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.728533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1841  cell divisionFtsK/SpoIIIE  59.57 
 
 
826 aa  905  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0705875  normal  0.65267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3137  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.95 
 
 
1040 aa  737  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.321844  normal  0.346965 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2944  DNA translocase FtsK  52.19 
 
 
808 aa  739  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1495  DNA translocase FtsK  66.86 
 
 
1094 aa  684  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0059  DNA translocase  62.99 
 
 
995 aa  695  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771975  hitchhiker  1.33062e-06 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2101  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.84 
 
 
871 aa  911  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0889775  decreased coverage  0.00141598 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6133  ftsK cell division protein  71.09 
 
 
954 aa  722  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  88.16 
 
 
833 aa  1461  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  77.83 
 
 
825 aa  1230  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0428  DNA translocase FtsK  64.55 
 
 
963 aa  694  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3663  DNA translocase FtsK  63.1 
 
 
797 aa  637  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1879  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.65 
 
 
882 aa  752  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2673  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.12 
 
 
894 aa  687  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0060  DNA translocase FtsK  65.74 
 
 
1015 aa  686  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.513164  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0093  FtsK/SpoIIIE family protein  53.99 
 
 
806 aa  819  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0291  FtsK/SpoIIIE family protein  70.1 
 
 
872 aa  720  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  66.86 
 
 
1094 aa  684  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.131308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0090  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
835 aa  1685  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2900  cell division FtsK/SpoIIIE  68.13 
 
 
1091 aa  691  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.694821  normal  0.686839 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0444  cell divisionFtsK/SpoIIIE  78.2 
 
 
823 aa  1226  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0378  cell divisionFtsK/SpoIIIE  67.7 
 
 
809 aa  688  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.373989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0133  DNA translocase  75.95 
 
 
825 aa  1238  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.780968 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0460  putative cell division protein FtsK  70.91 
 
 
819 aa  744  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.83979  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1823  putative cell division protein FtsK  57.13 
 
 
874 aa  852  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.603207  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0276  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.31 
 
 
815 aa  1291  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.251669  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.64 
 
 
1134 aa  756  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  68.01 
 
 
807 aa  687  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0464  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.4 
 
 
888 aa  771  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4236  ftsK cell division protein  56.29 
 
 
880 aa  858  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2891  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.04 
 
 
1153 aa  765  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313219  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3768  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.6 
 
 
895 aa  742  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.64 
 
 
1091 aa  756  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_004310  BR1895  cell division protein FtsK, putative  57.13 
 
 
854 aa  851  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.627487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1816  cell divisionFtsK/SpoIIIE  73.93 
 
 
852 aa  772  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0530  cell division protein FtsK, putative  71.1 
 
 
821 aa  744  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.42 
 
 
881 aa  878  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2377  cell divisionFtsK/SpoIIIE  57.73 
 
 
871 aa  911  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106397  normal  0.445419 
 
 
-
 
NC_002978  WD0120  cell division protein FtsK, putative  61.34 
 
 
704 aa  670  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0282  cell divisionFtsK/SpoIIIE  79.45 
 
 
822 aa  1257  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0782905  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4092  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.35 
 
 
889 aa  742  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2096  cell divisionFtsK/SpoIIIE  65.08 
 
 
726 aa  670  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.775363  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3749  cell divisionFtsK/SpoIIIE  70.81 
 
 
1135 aa  749  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.754842  normal  0.0843954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4120  cell divisionFtsK/SpoIIIE  76.29 
 
 
902 aa  766  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4908  cell divisionFtsK/SpoIIIE  74.9 
 
 
1221 aa  762  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4104  cell divisionFtsK/SpoIIIE  71.21 
 
 
787 aa  733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2053  cell divisionFtsK/SpoIIIE  56.74 
 
 
872 aa  899  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.02 
 
 
1136 aa  756  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4424  cell divisionFtsK/SpoIIIE  72.95 
 
 
781 aa  733  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.843774  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0212  cell divisionFtsK/SpoIIIE protein  58 
 
 
848 aa  629  1e-179  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2007  cell divisionFtsK/SpoIIIE  63.37 
 
 
912 aa  632  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.125828  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0890  putative cell division protein FtsK  59.46 
 
 
827 aa  627  1e-178  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.452147  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2669  cell divisionFtsK/SpoIIIE  60.46 
 
 
792 aa  622  1e-177  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894947  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  58.85 
 
 
809 aa  602  1e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0435  DNA translocase FtsK  60.28 
 
 
793 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1615  DNA translocase FtsK  53.69 
 
 
1477 aa  557  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.962365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4392  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.23 
 
 
757 aa  522  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.02 
 
 
716 aa  507  1e-142  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2360  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.17 
 
 
1202 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.647961  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0647  FtsK-like cell division protein  49.54 
 
 
751 aa  503  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.212332  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3382  DNA translocase FtsK  53 
 
 
776 aa  500  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.265787 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1519  cell divisionFtsK/SpoIIIE  55.6 
 
 
786 aa  502  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3178  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.83 
 
 
784 aa  499  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1719  cell divisionFtsK/SpoIIIE  48.78 
 
 
1157 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.19 
 
 
763 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.947558  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4078  DNA translocase FtsK  53.29 
 
 
769 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5363  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.17 
 
 
787 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.52695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2004  DNA translocase FtsK  56.08 
 
 
769 aa  502  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.23 
 
 
774 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1933  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.08 
 
 
786 aa  498  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440835  normal  0.487385 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1613  DNA translocase FtsK  51.66 
 
 
1299 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457522  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2685  cell divisionFtsK/SpoIIIE  51.66 
 
 
1310 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00501186  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3256  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.92 
 
 
917 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00372122  unclonable  9.48051e-12 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1827  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50 
 
 
789 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.346925  hitchhiker  7.83388e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2596  DNA translocase FtsK  51.66 
 
 
1310 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.51266e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3970  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.04 
 
 
774 aa  499  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146887  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2720  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53 
 
 
776 aa  499  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1285  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53.6 
 
 
799 aa  497  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.139445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1120  DNA translocase FtsK  50.94 
 
 
777 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.149955 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1730  hypothetical protein  39.6 
 
 
794 aa  496  1e-139  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0367  DNA translocase FtsK  52.28 
 
 
760 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219387  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3112  cell division protein FtsK, putative  51.8 
 
 
745 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.711537  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3598  cell divisionFtsK/SpoIIIE  50.67 
 
 
814 aa  493  1e-138  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1550  cell divisionFtsK/SpoIIIE  46.59 
 
 
866 aa  496  1e-138  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1693  DNA translocase FtsK  48.79 
 
 
782 aa  495  1e-138  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.477366 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0764  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.88 
 
 
821 aa  495  1e-138  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0546  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.23 
 
 
733 aa  495  1e-138  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.803279  hitchhiker  9.50013e-05 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  52.32 
 
 
1174 aa  494  1e-138  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.535537  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2306  cell division protein FtsK, putative  47.13 
 
 
911 aa  492  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2011  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.93 
 
 
896 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.46975e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1990  cell division protein FtsK  52.39 
 
 
768 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3211  cell divisionFtsK/SpoIIIE  53 
 
 
818 aa  489  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.129812  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2990  DNA translocase FtsK  52.39 
 
 
822 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01038  DNA translocase FtsK  49.37 
 
 
786 aa  492  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.37301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>